تأثیر دقت برآورد اثرات جایگاه‌های ژن‌های کمی (QTL) بر انتخاب به کمک مارکرهای ژنتیکی با در نظر گرفتن انحراف غالبیت

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقاله 4، دوره 9، شماره 3 - شماره پیاپی 31، مهر 1396، صفحه 357-362   

نوع مقاله: علمی پژوهشی- ژنتیک و اصلاح دام و طیور

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.v9i3.36829

نویسندگان

مجتبی طهمورث پور^{* 1}؛ نصیرالدین مقدر²

¹گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.

²دانشکده منابع طبیعی و کشاورزی، دانشگاه نیوانگلند، آرمیدال، استرالیا

چکیده

هدف از این مطالعه بررسی تأثیر خطای برآورد اثرات QTL با در نظر گرفتن وجود انحراف غالبیت بر پاسخ به انتخاب به کمک مارکرهای ژنتیکی بود. جمعیتی پایه برابر 1000 نفر غیرخویشاوند و غیرهمخون بر اساس وراثت‌پذیری‌های 1/0 و 3/0 که تحت تأثیر QTL با اثرات مختلف افزایشی و غابیت و اثر پلی ژنتیک باقی‌مانده قرار داشتند شبیه‌سازی گردید. اثرات QTL با خطای صفر، ده و بیست درصد در نظر گرفته شد و دو سطح غالبیت کامل و غیر کامل برای QTL فرض گردید. پاسخ به انتخاب برای انتخاب به کمک مارکر و انتخاب بدون استفاده از مارکر محاسبه گردید. پاسخ به انتخاب بر اساس انتخاب توده‌ای ۲۰ درصد از افرادی که بیشترین شاخص انتخاب را داشته‌اند محاسبه گردید. نتایج نشان داد انتخاب به کمک مارکرهای ژنتیکی باعث افزایش پاسخ به انتخاب می‌شود اما وجود اثرات غالبیت در شرایطی که اثر QTL با خطا توام باشد باعث کاهش پاسخ به انتخاب می‌گردد و در شرایطی که خطای برآورد بالا باشد پاسخ به انتخاب به کمک مارکر کمتر از پاسخ انتخاب بدون استفاده از مارکر خواهد بود. نتایج این آزمایش نشان داد پارامترهای QTL قبل از استفاده در برنامه‌های اصلاحی کاربردی بایستی از دقت بالا برخوردار باشد.

کلیدواژه‌ها

انتخاب به کمک مارکر؛ انحراف غالبیت؛ جایگاه‌های ژن‌های کمی

مراجع

1- Dekkers, J. C. M, and F. Hospital. 2002. The use of molecular genetics in improvement of agricultural populations. Nature Reviews Genetics, 3: 22–32.

2- Dalton, R. 2009. No bull: genes for better milk. Nature, 457: 369-369.

3- Oltenacu, P. A, and D. M. Broom. 2010. The impact of genetic selection for increased milk yield on the welfare of dairy cows. Animal Welfare, 19: 39-49.

4- Lande, R, and R. Thompson. 1990. Efficiency of marker-assisted selection in the improvement of quantitative traits. Genetics, 124: 743–756.

5- Meuwissen T. H. E, and J. A. M. Van Arendonk. 1992. Potential improvements in rate of genetic gain from marker-assisted selection in dairy cattle breeding. Journal of Dairy Science, 75: 1651-1659.

6- Ruane J, and J. J. Colleau. 1994. The value of marker assisted selection when one QTL is marked. Page 80 in Proc. The 46th Annual Meeting European, Association for Animal Production, Edinburgh, UK.

7- Meuwissen, T. H. E. and M. E. Goddard. 1996. The use of marker haplotypes in animal breeding schemes. Genetics Selection Evolution, 28:161-176.

8- Dekkers, J. C. M, and F. Hospital. 2002. Utilization of molecular genetics in genetic improvement of plants and animals. Nature Reviews: Genetics, 3: 22-32.

9- Villanueva, B., R. Pong-Wong., J. Fernandez, and M. A. Toro. 2005. Benefits from marker-assisted selection under an additive polygenic genetic model. Journal of Animal Science, 83: 1747–1752.

10- Goddard, M. E, and B. J. Hayes. 2002. Optimisation of response using molecular data. Page 22 in Proc. The 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Montpellier, France.

11- Goddard. M. E. 2008. Genomic selection: prediction of accuracy and maximisation of long term response. Genetica, 136(2): 245-257.

12- Meuwissen, T. H. E., B. J. Hayes, and M. E. Goddard. 2001. Prediction of total genetic value using genome-wide dense marker maps. Genetics, 157: 1819–1829.

13- Falconer, D. S, and T. F. C. Mackay. 1996. Introduction to Quantitative Genetics. 4th ed. Longmans Green, Harlow, Essex, UK.

14- Dekkers, J. C. M. 2004. Commercial application of marker and gene assisted selection in livestock: strategies and lessons. Journal Animal Science, 82: E313-E328.

15- Spelman, R. J, and J. A. M. Van Arendonk. 1997. Effect of inaccurate parameter estimates on genetic response to marker-assisted selection in an outbred population. Journal of Dairy Science, 80(12): 3399-3410.

16- Palucci, V., L. R. Schaeffer., F. Miglior, and V. Osborne. 2007. Non-additive genetic effects for fertility traits in Canadian Holstein cattle. Genetics Selection Evolution, 39: 181–193.