Aspergillus Fumigatus در ANXC4 جداسازی جزء به جزء در تحلیل پروفایل پروتئینی موتانت ژن

Journal of Cell and Molecular Research

Article 5, Volume 10, Issue 2 - Serial Number 20, January 0, Pages 90-96   

Document Type: Research Articles

DOI: 10.22067/jcmr.v10i2.73401

Authors

الهام ارمی^{* 1}; فریدون صادق زاده²

¹دانشگاه آزاد علوم تحقیقات، تهران

²دانشگاه تهران

Abstract

Aspergillus fumigatus یکی از قارچ های رشته ای پاتوژن است که می تواند باعث عفونت های فرصت طلب ، آلرژی و مسمومیت ها شود. از آنجا که سکانس ژنی تعدادی از این قارچ ها اخیراً کامل شده است شناسایی پروفایل پروتئینی این سلول های قارچی ضروری است. یکی از این ژن ها، خانواده ی Annexin است. Annexin C4 یکی از اعضای این خانواده در قارچ ها است. در این مطالعه اثر جهش در ژن ANXC4 در پروفایل پروتئینی قارچ A. fumigatus مورد بررسی قرار گرفته است. علاوه بر این به منظور افزایش کارایی جداسازی پروتئین ها پیش از بررسی پروفایل پروتئینی تکنیک از پیش جزء به جزء کردن مطابق یک روش بهینه انجام گرفت. در این تحقیق با استفاده از کروماتوگرافی مایع فازمعکوس با کارایی بالا، 8 فراکشن جداشده سپس هرکدام از فراکشن ها با استفاده از تکنیک SDS Page برای تایید غلظت های پروتئینی روی ژل الکتروفورز نیز جداسازی شدند. پروفایل پروتئین های این سه فراکشن با استفاده از تکنیک الکتروفورز دو بعدی مورد بررسی قرار گرفته شد و با استفاده از نر افزار IMEAG MASTER نتایج آنالیز گردید. در میان پروتئین هایی که با روش آماری شناسایی گردید دو پروتئین نوظهور مشاهده گردید. نتایج نشان دادند که بیان ژن ANXC4 بیان تعدادی از پروتئین های دیگر را در قارچ A. fumigatus تحت تاثیر قرار می دهد. برای شناسایی دقیق تر این پروتئین ها آزمایش هایی از جمله آنالیز های اسپکترومتری مورد نیاز است.

Keywords

آسپرژیلوس فومیگاتوس; کروماتوگرافی مایع فاز معکوس با کارایی بالا; الکتروفورز دو بعدی; پروفایل پروتئینی

References

Anderson, N. L., Matheson, A. D. and Steiner, S. (2000) Proteomics: Applications in basic and applied biology. Current Opinion in Biotechnology, pp. 408–412.

Badock, V. Steinhvsen,V.,Bommert,K.,Otto,A. (2001) Prefractionation of protein samples for proteome analysis using reversed-phase high-performance liquid chromatography. Electrophoresis, 22(14), pp. 2856–2864.

Dagenais, T. R. T. and Keller, N. P. (2009) Pathogenesis of Aspergillus fumigatus in invasive aspergillosis. Clinical Microbiology Reviews. American Society for Microbiology (ASM), pp. 447–465.

Debeaupuis, J. P. Sarfati,J.,Chazlet,V.,and paullatge,.J.(1997) Genetic diversity among clinical and environmental isolates of Aspergillus fumigatus. Infection and immunity, 65(8), pp. 3080–5.

Gerke, V. and Moss, S. E. (2002) Annexins: From Structure to Function. Physiological Reviews, 82(2), pp. 331–371.

Govorun, V. M. and Archakov, A. I. (2002) Proteomic technologies in modern biomedical science. Biochemistry (Moscow), pp. 1109–1123.

Karpievitch, Y. V ,.polpitiya,A.D.,Anderson,G.D.,Smith,R.D.,andDabney,A.R. (2010) Liquid chromatography mass spectrometry-based proteomics: Biological and technological aspects. Annals of Applied Statistics, 4(4), pp. 1797–1823.

Khalaj, K., Aminollahi, E., Bordbar, A., and Khalaj, V., Fungal annexins: a mini review (2015)

Khalaj, V. Smith,L.,Brookman,J.,Tuckwell,D. (2004) Identification of a novel class of annexin genes. FEBS Letters, 562(1–3), pp. 79–86.

Khalaj, V. Azarian,B.,Enayati,S.,Vaziri,B. (2011)Annexin C4 in A. Fumigatus: A proteomics approach to understand the function. Journal of Proteomics, 74(10), pp. 1950–1958.

Latge, J. P. (2001) The pathobiology of Aspergillus fumigatus. Trends in Microbiology, pp. 382–389.

Maryam, M., FU, M, S., Alaiano, A., Camacho, E., Diego, G., Faneuff, E. E. (2019)The enigmatic role of fungal annexins: the case of cryptococcus neoformans

Moss, S. E. and Morgan, R. O. (2004) The annexins. Genome Biology. BioMed Central, p. 219.

Neverova, I. and Van Eyk, J. E. (2005) Role of chromatographic techniques in proteomic analysis. Journal of Chromatography B: Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, pp. 51–63.

Righetti, P. G. Castagna, A.Herbert,B. Reymond,F.Rossier,J.S.(2003) Prefractionation techniques in proteome analysis. in Proteomics, pp. 1397–1407.

Righetti, P. G. Castagna, A.AntonioliL, P.(2005) Prefractionation techniques in proteome analysis: The mining tools of the third millennium. Electrophoresis, pp. 297–319.

Ronning, C. M. Fedorova, N.D., Bowyer, P., Coulson, R., Goldman, G., Kim, H.S., Turner, G., Wortman, J.R., Yu, J., Anderson, M.J., Denning, D.W., Nierman, W.C. (2005)Genomics of Aspergillus fumigatus. Revista Iberoamericana de Micologia, pp. 223–228.

Srinivas, P. R., Verma , M.,Zhao , Y., and Srvastava, S. (2002) Proteomics for cancer biomarker discovery. Clinical Chemistry, pp. 1160–1169.

Van Eyk, J. E. (2001) Proteomics: unraveling the complexity of heart disease and striving to change cardiology. Curr Opin Mol Ther, 3(6), pp. 546–553.

Vaziri, B. ,Rahimpour,M.,Eslami,N.,Fayaz,A.,Rahimian,H. (2006) RP-HPLC prefractionation and its application in expressional proteomics analysis of an in vitro viral infection model. Journal of Separation Science, 29(15), pp. 2284–2291.