همسانهسازی، تنوع ژنتیکی ژن رمزکننده پروتئین پوششی و تعیین زیرگروههای نژادی جدایههای ویروس موزائیک خیار در مزارع طالبی شهرستان ورامین | ||
| پژوهش های حفاظت گیاهان ایران | ||
| مقاله 1، دوره 33، شماره 2 - شماره پیاپی 44، 1398، صفحه 123-133 اصل مقاله (812.66 K) | ||
| نوع مقاله: مقالات پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/jpp.v33i2.72268 | ||
| نویسندگان | ||
| مجید جعفری* 1؛ سمیه قلی زاده روشنق2؛ شاهین نوری نژاد زرقانی2 | ||
| 1مجتمع آموزش عالی سراوان | ||
| 2پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران | ||
| چکیده | ||
| منطقهی ورامین واقع در جنوب تهران یکی از مراکز مهم تولید خربزه و طالبی است. اخیرا تغییر در جمعیت ویروسهای کدوئیان گزارش شده است. از اینرو، به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ویروس موزائیک خیار و بررسی تغییر احتمالی جمعیت این ویروس در مزارع طالبی مناطق ورامین، پیشوا و پاکدشت، 132 نمونهی برگی طی سالهای 1393 و 1394 با علایم مشکوک به آلودگی ویروسی شامل موزاییک، پیسک و بدشکلی برگ و نیز کوتولگی گیاه جمعآوری شد. آلودگی 59 نمونه از کل نمونهها (69/44 درصد) به CMV توسط آزمون الایزا تعیین شد که نشان دهنده میزان آلودگی بالای گیاهان طالبی نمونه‌برداری شده از مزارع مورد مطالعه است. از نمونههای الایزا مثبت، آر‌آن‌ای کل استخراج و ژن پروتئین پوششی به همراه بخشیهایی از اطراف آن طی RT-PCR تکثیر شد. برای تعیین زیرگروههای جدایههای جمعآوری شده، محصولات RT-PCR با استفاده از آنزیم MspI (HpaII) برش داده شدند که در اثر آن قطعاتی به اندازههای 335 و 537 جفت باز تولید شدند. بر این اساس جدایههای جمعآوری شده در این مطالعه در گروه I قرار گرفتند. ژن CP در چهار جدایه که بر اساس فاصله مکانی انتخاب شده بودند به حامل pTG19-T متصل و در میزبانEscherichia coli همسانهسازی شد. نتایج تعیین توالی، وجود جایگاه برشی آنزیم MspI را در موقعیت یاد شده تأیید کرد. چهار جدایهی تعیین توالی شده در این پژوهش، 99-100 درصد در سطح اسیدهای نوکلئیک و همچنین 100 درصد در سطح آمینواسیدی با یکدیگر تشابه داشتند. میزان تشابه این جدایهها با جدایههای از قبل گزارش شده از ایران به ترتیب 93-100 و 98-100 درصد در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی دیده شد. نتایج فیلوژنی در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی نیز نتایج RT-PCR-RFLP را تأیید نمود و مشخص شد که جدایههای CMV در مزارع طالبی ورامین متعلق به زیرگروه AI و جدایههایی با شدت بیماریزایی شدید هستند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| طالبی؛ فیلوژنی؛ ورامین؛ ویروس موزائیک خیار؛ RT-PCR-RFLP | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 5,023 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,067 |
||