بررسی بیوانفورماتیکی و جداسازی پروموتر بتافازئولین از لوبیا (Phaseolus vulgaris) | ||
| پژوهشهای حبوبات ایران | ||
| مقاله 8، دوره 8، شماره 2، 1396، صفحه 181-191 اصل مقاله (930.17 K) | ||
| نوع مقاله: مقالات پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijpr.v8i2.50075 | ||
| نویسندگان | ||
| ادریس چوپانی* 1؛ خدیجه باقری2؛ بهرام ملکی زنجانی3 | ||
| 1دانشگاه زنجان | ||
| 2دانشگاه تربیت مدرس | ||
| 3انستیتو تحقیقات کشاورزی هند- دهلی نو | ||
| چکیده | ||
| جهت اجتناب از مضرات پروموترهای عمومی، شناسایی و جداسازی پروموترهای قوی و اختصاصی بافت امری بسیار مهم و ضروری در مهندسی ژنتیک است. یکی از پروموترهای اختصاصی و قوی بذری، پروموتر بتافازئولین لوبیا میباشد که بیان حدود ۵۰درصد پروتئینهای بذر لوبیا را کنترل میکند. استفاده از این پروموتر برای بهینهکردن تولید پروتئینهای بذری در لوبیا و گیاهان دیگر و همچنین تولید پروتئینهای نوترکیب مفید خواهد بود. آنالیز بیوانفورماتیکی پروموترها برای پیشگویی در مورد قدرت و ضعف آنها، جداسازی صحیح و همچنین سنتز پروموترهای مصنوعی کمک خواهد کرد. ابتدا بهوسیله نرمافزارهای آنالیز پروموتر توالیهای پروموتری بتافازئولین گیاه لوبیا مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج حاصل نشان داد که بیش از ۲۰فاکتور سیس از جمله مهمترین آنها G-box، E-box، فاکتور RY،ACGTSEED2، جعبه لگومین، جعبه اندوسپرم و...در توالی پروموتر بتافازئولین وجود دارد که در بیان بالا و اختصاصیت آن نقش دارند. با توجه به نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی پرایمرهای اختصاصی این پروموتر طراحی شد و با استفاده از آنها توالی پروموتر موردنظر از DNA ژنومی لوبیا تکثیر و با توجه به اندازه قطعه تکثیرشده، صحت آن مورد تأیید قرار گرفت. در مرحله بعدی توالی پروموتر موردنظر در ناقل pTZ57R/T کلون شد و با استفاده از واکنشهای PCR و هضم آنزیمی مورد تأیید قرار گرفت. از آنجاییکه هدف از این تحقیق جداسازی پروموتر اختصاصی بذر بتافازئولین از لوبیا و استفاده از آن در تهیة سازههای ژنی میباشد، لذا قطعة موردنظر در ناقل بیانی گیاهی pBI121 سابکلون شد و نتایج آن با هضم آنزیمی و PCR تأیید شد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| پروموتر اختصاصی؛ پروموتر بذری؛ آنالیز بیوانفورماتیکی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 66,998 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 25,120 |
||