بررسی مولکولی شش جدایه ویروس زردی چغندر قند (Beet yellows virus) از استانهای آذربایجان غربی، کرمانشاه و همدان بر اساس ناحیه پروتئین پوششی | ||
| پژوهش های حفاظت گیاهان ایران | ||
| مقاله 18، دوره 28، شماره 4 - شماره پیاپی 26، 1393، صفحه 537-578 اصل مقاله (194.26 K) | ||
| نوع مقاله: مقالات پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/jpp.v28i4.28061 | ||
| نویسندگان | ||
| محدثه گرامی نوقابی* 1؛ محسن مهرور2؛ سیده عاطفه حسینی3 | ||
| 1فردوسی مشهد | ||
| 2دانشگاه فردوسی مشهد | ||
| 3دانشگاه بیرجند | ||
| چکیده | ||
| ویروس زردی چغندرقند (Beet yellows virus, BYV) متعلق به جنس Closterovirus و خانواده Closteroviridae از مهمترین ویروسهای چغندرقند به شمار میآید که در سراسر دنیا گسترده است. به منظور تعیین برخی از خصوصیات مولکولی این ویروس، در سال 1391 تعداد 75 نمونه برگی دارای علائم از مزراع عمده این محصول در استانهای آذربایجان غربی، کرمانشاه و همدان جمعآوری شد. نمونهها دارای علائمی نظیر زردی، رگبرگ روشنی و ضخیم و شکننده شدن برگ، بودند. نمونههای جمع آوری شده توسط آزمون سرولوژیکی الایزا و آزمون مولکولی RT-PCR مورد بررسی قرار گرفتند. در آزمون الایزا با استفاده از آنتیبادی اختصاصی آلودگی در 6 نمونه تایید شد. قطعهای مربوط به پوشش پروتینی به طول bp615 در آزمون مولکولی با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده BYV-F/R، تکثیر و در ژل آگارز 1 درصد الکتروفورز گردید. نتایج تعیین توالی و مقایسه توالیهای بدست آمده با جدایههای موجود در NCBI به وسیله نرم افزار DNAMAN7 نشان داد که جدایههای تعیین توالی شده دارای 99-89 درصد شباهت با جدایههای موجود در بانک ژن هستند. بیشترین درصد شباهت جدایههای ایرانی در سطح نوکلئوتیدی (19/99 درصد) و آمینو اسیدی (55/97 درصد)، با جدایه ای از اوکراین (X73476) میباشد. آنالیز فیلوژنتیکی جدایهها به وسیله نرم افزار MEGA5 انجام شد که طی آن جدایههای ایرانی در کنار جدایه اوکراین در یک گروه قرار گرفتند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| ویروس زردی چغندرقند؛ آذربایجان غربی؛ کرمانشاه و همدان؛ پروتئین پوششی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 10,516 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 3,319 |
||