شناسایی و بررسی مولکولی جدایهای از ویروس زردی چغندر قند (Beet yellows virus) در استان خراسان رضوی | ||
| پژوهش های حفاظت گیاهان ایران | ||
| مقاله 5، دوره 29، شماره 1 - شماره پیاپی 27، 1394، صفحه 55-59 اصل مقاله (188.13 K) | ||
| نوع مقاله: مقالات پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/jpp.v29i1.28056 | ||
| نویسندگان | ||
| محدثه گرامی نوقابی* 1؛ محسن مهرور2؛ محمد زکی عقل2 | ||
| 1فردوسی مشهد | ||
| 2دانشگاه فردوسی مشهد | ||
| چکیده | ||
| به منظور شناسایی و بررسی مولکولی ویروس زردی چغندرقند (Beet yellow virus, BYV) در سال 1392 از مزارع چغندرقند استان خراسان رضوی، تعداد 48 نمونه برگی درای علائم از مزراع عمده این محصول در این استان، جمعآوری شد. این علائم شامل زردی، رگبرگ روشنی، کوتولگی، ضخیم و شکننده شدن برگ بود. نمونههای جمعآوری شده توسط آزمون مولکولی RT-PCR مورد بررسی قرار گرفتند. در این آزمون با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده، قطعهای به طول bp615 مربوط به پروتئین پوششی ویروس تکثیر گردید. وجود این ناحیه تکثیر شده در نمونههای آلوده، نشان از آلودگی به ویروس مذکور را در مناطق بررسی شده دارد. قطعة تکثیر شده مربوط به جدایهای از سبزوار (S-J) از ژل استخراج و تعیین توالی گردید. نتیجه تعیین توالی و مقایسه توالی بهدست آمده با جدایههای موجود در بانک ژن به وسیله نرم افزار DNAMAN7 مورد آنالیز قرار گرفت. نتایج نشان داد که جدایه تعیین توالی شده دارای 94-85 درصد شباهت با جدایههای موجود در بانک ژن است. بیشترین درصد تشابه جدایه مورد بررسی در سطح نوکلئوتیدی (79/94درصد) و آمینو اسیدی (59/90 درصد)، با جدایهای از اوکراین (شماره دسترسی X73476) بود. بررسیهای فیلوژنتیکی به کمک نرم افزار MEGA5.2 انجام شد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| ویروس زردی؛ چغندرقند؛ خراسان رضوی؛ ایران | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 4,487 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,286 |
||