توالی یابی و آنالیز بیوانفورماتیکی ژن کاپا کازئین در جمعیت بزهای خلخالی ایران و سایر دامهای اهلی | ||
| پژوهشهای علوم دامی ایران | ||
| مقاله 6، دوره 9، شماره 2 - شماره پیاپی 30، تابستان 1396، صفحه 229-239 اصل مقاله (798.08 K) | ||
| نوع مقاله: علمی پژوهشی- ژنتیک و اصلاح دام و طیور | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.v9i2.55630 | ||
| نویسندگان | ||
| وحیده کریمی عوری1؛ نعمت هدایت ایوریق* 1؛ رضا سید شریفی2؛ سعید نیک بین1؛ یونس زاهدی دیزج یکان1 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران. | ||
| 2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقـق اردبیلی، اردبیل، ایران. | ||
| چکیده | ||
| در سالهای اخیر به طور عمده چند شکلیهای ژنتیک پروتئین شیر مورد توجه و تحقیق بیشتری بوده است. زیرا بین پروتئین شیر و صفات اقتصادی مهم در دام رابطه مستقیم وجود دارد. کاپا کازئین بهعنوان عمدهترین پروتئین موجود در شیر نقش مهمی در شکل گیری میسلهای موجود شیر و کمک به افزایش حلالیت کلسیم و فسفر ایفا میکند، از این رو این مطالعه با هدف و رویکرد بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه اگزون 4 ژن کاپا کازئین با روش توالی یابی در جمعیت بز خلخالی و مقایسه آن با سایر گونهها انجام گرفت. نتایج حاصل از توالیهای منجر به شناسایی یک جهش در نمونههای توالی یابی شده گردید که باعث تغییر نوکلئوتید C به T در جایگاه اگزون چهار ژن کاپا کازئین گردید که منجر به تغییر کدون CCT به TCT میشود و باعث جایگزینی اسید آمینه پرولین به جای سرین میشود. آنالیز تنوع ژنتیکی در جمعیت بز خلخالی 524/0 به دست آمدکه نشاندهنده تنوع ژنتیکی نسبتا مناسب میباشد. مقایسه توالیهای جمعیت خلخالی با گونههای مختلف مانند بز، گاو ، گوسفند و گاو میش منجر به شناسایی 41 جهش شد که ایجاد 29 هاپلوتایپ مختلف با تنوع هاپلوتایپی 833/0 در گونههای مورد مطالعه میکند. تنوع نوکلئوتیدی و میانگین تفاوت نوکلئوتیدی (k) در بین گونهها نیز به ترتیب برابر 04469/0 و 75436/ 11 به دست آمد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| تنوع نوکلئوتیدی؛ توالی یابی؛ چند شکلی تک نوکلئوتیدی؛ کاپا کازئین؛ هاپلوتیپ | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 12,037 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,091 |
||