شناسایی چند شکلی تک نوکلئوتیدی بخشی از ژن LEP و ارتباط آن با صفات لاشه در گوسفندان افشاری و افشاری× برولامرینو

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقاله 5، دوره 9، شماره 3 - شماره پیاپی 31، مهر 1396، صفحه 363-375   

نوع مقاله: علمی پژوهشی- ژنتیک و اصلاح دام و طیور

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.v9i3.57781

نویسندگان

رحیمه سپهری¹؛ صادق علیجانی¹؛ جلیل شجاع غیاث¹؛ محمدطاهر هرکی نژاد^{* 2}؛ سید عباس رأفت¹

¹گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران

²گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

چکیده

لپتین یک پروتئین 16کیلودالتونی است که در کنترل اشتها، تعادل انرژی و توزیع ذخیره چربی در بدن نقش دارد. هدف مطالعه حاضر، شناسایی آللهای احتمالی این ژن در ناحیه اگزون 3 بود. برای این منظور تعداد 133 رأس بره از یک گله و در سن تقریبا یکسان در سه گروه افشاری خالص و نسل F2 و F5 آمیخته افشاری- برولامرینو مورد استفاده قرار گرفتند. پس از خون گیری و انجام اندازه گیری های فنوتیپی بر روی دام زنده، تعداد 85 رأس از آن ها کشتار شدند. ، وزن لاشه بعد از کشتار و وزن ران، سردست، قلوه گاه، دنبه و ضایعات بعد از 24 ساعت ماندن لاشه در سردخانه، بدست آمد. محصولات PCR جهت شناسایی SNP (های) احتمالی، مستقیماً توالی یابی و دو SNP شناسایی شدند. تعیین ژنوتیپ نمونه های توالی یابی نشده به روش RFLP و به کمک دو آنزیم برشی Hpa II و AIwN I انجام شد. در چندشکلی اول سه ژنوتیپ GG ,GA و AA مشاهده شد. این چندشکلی سبب تغییر اسیدآمینه آرژینین به گلوتامین در کدون شماره 142 می شود و بر میزان چربی پشت و ارتفاع جدوگاه تأثیر معنی داری داشت. چندشکلی بعدی در میان نمونه ها دارای دو ژنوتیپ GG و GA بود که تغییر اسیدامینه ای مشابه را در کدون شماره 196 ایجاد می کند و با اندازه طول بدن ارتباط (p=0.077) نشان داد. بر اساس نتایج بدست آمده، مطالعات گذشته و نیز در صورتی که ارتباط این تغییرات با صفات ذکرشده در سطحی وسیعتر مورد تایید قرار گیرد چند شکلی اول می تواند در برنامه انتخاب دام به کمک نشانگرها مورد استفاده قرار گیرند.

کلیدواژه‌ها

چند قلوزایی؛ کیفیت لاشه؛ گوسفند افشاری؛ هورمون لپتین؛ SNP

مراجع

1- Barzehkar, R., A. Salehi, and F. Mahjoubi. 2009. Polymorphisms of the Ovine Leptin Gene and its Association with Growth and Carcass Traits in Three Iranian Sheep Breeds. Iranian Journal of Biotechnology, 7: 241-6. (In Persian).

2- Boucher, D., M. Palin., F. Castonguay., C. Gariepy, and F. Pothier. 2006. Detection of polymorphisms in the ovine leptin (LEP) gene: Association of a single nucleotide polymorphism with muscle growth and meat quality traits. Canadian Journal of Animal Science, 86: 31-5.

3- Buchanan, F. C., C. J. Fitzsimmons., A. G. Van Kessel., T. D. Thue., D. C. Winkelman-Sim, and S. M. Schmutz. 2002. Association of a missense mutation in the bovine leptin gene with carcass fat content and leptin mRNA levels. Genetics Selection Evolution, 34: 105-16.

4- Cauveri, D., S. Sivaselvam., S. Karthickeyan., K. Tirumurugaan, and K. Kumanan. 2014. Allelic polymorphysm of exon3 of leptin gene in nilagiri sheep identified by sequencing and PCR-RFLP. International Journal of Science, Environment and Technology, 3: 951- 5.

5- De, S., M. MacNeil., X. Wu., J. Michal., Q. Xiao., M. Garcia., K. Griffin., C. Gaskins., J. Reeves, and J. Busboom. 2004. Detection of quantitative trait loci for marbling and backfat in Wagyu x Limousin B1 crosses using a candidate gene approach. Journal of Animal Science Supplement, 82(2): 111-114.

6- Fitzsimmons, C.J., S. M. Schmutz., R. D. Bergen, and J. J. McKinnon. 1998. A potential association between the BM 1500 microsatellite and fat deposition in beef cattle. Mammalian Genome, 9: 432-434.

7- Houseknecht, K .L., C. A. Baile., R. L. Matteri, and M. E. Spurlock. 1998. The biology of leptin: a review. Journal of Animal Science, 76: 1405-1420.

8- Huang, D. l., R. J. Chen., Z. P. Yang., Y. J. Mao., Y. L. Li., D. J. Tian., L. Chen, an X. Y. Zhao. 2008. Analysis on associations of SNPs of leptin gene with growth traits in four sheep breeds. Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences, 12: 002 (Abstract).

9- Jonas, E., G. Martin., P. Celi., L. Li., M. Soattin., P. Thomson, and H. Raadsma. 2016. Association of polymorphisms in leptin and leptin receptor genes with circulating leptin concentrations, production and efficiency traits in sheep. Small Ruminant Research, 136: 78-86.

10- Khaldari, M. 2014. The basic of sheep and goat farming (Osoole parvaresh goosfand va boaz). Tehran Jihaad daneshgahi, Tehran, Iran. (In Persian).

11- Khorramtaie, R., M. Nezamabadi., T. Harkinezhad., M. P. Eskandari nasab., M. H. Shahir, and D. Salimi. 2012. Evaluation of directly and ultrasound measurements of muscle and back fat for prediction of Carcass traits of live animals in Afshari sheep. Iranian Journal of Animal Science Research. 22(2): 161-171. (In Persian).

12- Mahmoud, A., A. Saleh., F. Abou-Tarboush., T. Shafey, and M. Abouheif. 2014c. Nucleotide sequence polymorphism within exon 3 region of leptin and prolactin genes in Herri sheep. Research Journal of Biotechnology, 9: 69-72.

13- Mahmoud, A., A. Saleh., N. Almealamah., F. Abou-tarboush., R. Aljumaah., T. Shafey, and M. Abouheif. 2014. Molecular Characterization of Leptin Exon 3 gene in sheep of Saudi Arabia. Research Journal of Biotechnology, 9: 32-35.

14- Roh, S. G., D. Hishikawa., Y. H. Hong, and S. Sasaki. 2006. Control of adipogenesis in ruminants. Animal Science Journal, 77: 472-477.

15- Smithz, M., H. Dolezal., R. Gill, and B. Behrens. 1992. Evaluation of Ultrasound for Prediction of Carcass Fat Thickness and Longissimus Muscle Area in Feedlot Steers1. Journal of Animal Science, 70(1): 29-37.

16- Stone, R., S. Kappes, and C. Beattie. 1996. The bovine homolog of the obese gene maps to chromosome 4. Mammalian Genome, 7: 399-400.

17- Zhou, H., J. G. Hickford, and H. Gong. 2009. Identification of allelic polymorphism in the ovine leptin gene. Molecular Biotechnology, 41: 22-25.