تحلیل شجره و بررسی همخونی در گوسفند نژاد لری ‌بختیاری

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقاله 10، دوره 9، شماره 3 - شماره پیاپی 31، مهر 1396، صفحه 376-386   

نوع مقاله: علمی پژوهشی- ژنتیک و اصلاح دام و طیور

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.v9i3.58603

نویسندگان

محمد کشاورزپور؛ محمد رضا بحرینی بهزادی^* ؛ مصطفی محقق دولت آبادی

دانشگاه یاسوج

چکیده

هدف از این پژوهش بررسی تنوع و ساختار ژنتیکی و همچنین بررسی کاهش عملکرد ناشی از همخونی صفات وزن بدن در سنین مختلف در گوسفندان لری‌ بختیاری بود. از اطلاعات مربوط به 7693 رأس دام (2478 رأس بره نر و 5215 رأس بره ماده‌) متولد سال‌های 1368 تا 1389 حاصل از 274 رأس قوچ و 2006 رأس میش استفاده شد. برای محاسبه ضرایب همخونی از نرم‌افزار CFC، تحلیل‌های شجره از نرم‌افزار ENDOG و محاسبه تابعیت صفات از همخونی، از نرم‌افزار WOMBAT استفاده شد. برای توصیف تنوع ژنتیکی این جمعیت از فراسنجه‌های تحلیل احتمال منشأ ژن استفاده گردید. تعداد حیوانات بنیان‌گذار، تعداد مؤثر حیوانات بنیان‌گذار، تعداد مؤثر اجداد، تعداد مؤثر ژنوم حیوانات بنیان‌گذار، تعداد مؤثر ژنوم حیوانات غیر بنیان‌گذار به ‌ترتیب 506، 105، 90، 65 و 181 رأس برآورد شد. میانگین فاصله نسل در این جمعیت 23/4 سال و اندازه مؤثر جمعیت 249 رأس بود. متوسط هم‌تباری و متوسط ضریب همخونی به ‌ترتیب 76/0 و 56/0 درصد برآورد شد. ضریب تابعیت وزن‌های تولد، شیرگیری، شش ‌ماهگی، نه‌ ماهگی و یک ‌سالگی از همخونی به ترتیب 11-، 6/106-، 7/259-، 2/161- و 9/239- گرم محاسبه شد. نتایج حاصل از فراسنجه‌های تحلیل احتمال منشأ ژن نشان دهنده کاهش تنوع ژنتیکی این جمعیت بود. میزان کاهش عملکرد ناشی از همخونی صفات وزن بدن در گوسفندان لری‌ بختیاری مورد مطالعه نسبت به گزارش‌های سایر نژادها در ایران بیشتر بود که نشان دهنده جفتگیری‌های افراد خویشاوند در این گله می‌باشد. همچنین وجود کاهش عملکرد ناشی از همخونی صفات وزن بدن نیز کاهش تنوع ژنتیکی جمعیت مورد مطالعه را تأیید کرد.

کلیدواژه‌ها

ساختار شجره؛ صفات رشد؛ گوسفند لری ‌بختیاری؛ همخونی

مراجع

1- Adeli Khah, M. H., R. Vaez Torshizi., M. Rokouei, and D. Tohidi. 2008. Inbreeding and its effects on production traits Iranian Zandi sheep. Pages 1-4 in Proc. 3rd Congress on Animal Science, Mashhad, Iran. (In Persian).

2- Bahri Binabaj, F., H. Faraji Arogh., M. Rokouei., M. Jafari, and A. Mohammad Hashemi. 2012. Estimation of inbreeding trend and its effect on growth traits, longevity and skin score of Karakul sheep breed. Pages 760-764 in Proc. 5th Congress on Animal Science, Isfahan, Iran. (In Persian).

3- Barker, J. S. F. 2001. Conservation and management of genetic diversity: a domestic animal perspective. Canadian Journal of Forest Research, 31(4): 588-595.

4- Boichard, D., L. Maignel, and E. Verrier. 1997. The value of using probabilities of gene origin to measure genetic variability in a population. Genetics Selection Evolution, 29: 5–23.

5- Caballero, A., and M. A. Toro. 2000. Interrelations between effective population size and other pedigree tools for the management of conserved populations. Genetical Research, 75: 331–343.

6- Cassell, B. G., V. Adamec, and R. E. Pearson. 2003. Effects Effects of incomplete pedigree on estimates of inbreeding and inbreeding depression for days to first service and summit milk yield in Holsteins and Jerseys. Journal of Dairy Science, 86: 2967–2976.

7- Dorostkar, M., H. Faraji Arough., J. Shodja., S. A. Rafat., M. Rokouei, and H. Esfandyari. 2012. Inbreeding and inbreeding depression in Iranian Moghani sheep breed. Journal of Agriculture Science and Technology, 14: 549-556.

8- Duchev, Z., O. Distl, and E. Groeneveld. 2006. Early warning system for loss of diversity in European livestock breeds. Archiv Tierzucht, 49: 521-531.

9- Falconer, D. S., and F. C. Mackay. 1996. Introduction to Quantitative Genetics. Longman, Harlow, UK.

10- FAO, 1998. Secondary guidelines for development of national farm animal genetic resources management plans: management of small populations at risk. Food and Agriculture Organization, Rome, Italy.

11- Ghafouri-Kesbi, F. 2010. Analysis of genetic diversity in a close population of Zandi sheep using genealogical information. Journal of Genetics, 89: 479–483.

12- Ghafouri-Kesbi, F. 2012. Using pedigree information to study genetic diversity and reevaluating a selection program in an experimental flock of Afshari sheep. Archiv Tierzucht, 55(4): 375–384.

13- Gholambabaeian, M. M., A. Rashidi., M. Razmkabir, and E. Mirzamohammadi. 2012. Inbreeding coefficient estimate and its effects on pre-weaning traits in Moghani sheep. Pages 71-75 in Proc. 5th Congress on Animal Science, Isfahan, Iran. (In Persian).

14- Goyache, F., J. P. Gutierrez., I. Fernandez., E. Gomez., I. Alvarez., J. Dıez, and L. J. Royo. 2003. Using pedigree information to monitor genetic variability of endangered populations: the Xalda sheep breed of Asturias as an example. Journal of Animal Breeding and Genetics, 120: 95–103.

15- Gutierrez, J. P., and F. Goyache. 2005. A note on ENDOG: a computer program for analysing pedigree information. Journal of Animal Breeding and Genetics, 122(3): 172-176.

16- Gutierrez, J. P., I. Cervantes, and F. Goyache. 2009. Improving the estimation of realized effective population sizes in farm animals. Journal of Animal Breeding and Genetics, 126(4): 327–332.

17- Huby, M., L. Griffon., S. Moureaux., H. De Rochambeau., C. Danchin-Burge, and E. Verrier. 2003. Genetic variability of six French meat sheep breeds in relation to their genetic management. Genetics Selection Evolution, 35(6):637–655.

18- Lacy, R. C. 1989. Analysis of founder representation in pedigrees: Founder equivalents and founder genome equivlents. Zoo Biology, 8(2): 111-123.

19- Li, M. H., I. Stranden, and J. Kantanen. 2009. Genetic diversity and pedigree analysis of the Finnsheep breed. Journal of Animal Science, 87(5): 1598–1605.

20- Mehmannavaz, Y., R. Vaez Torshizi., A. Salehi, and A. Shourideh. 2002. Inbreeding and its effects on production traits in Iranian Baluchi sheep. Pages 264-269 in Proc. the first seminar on genetics and breeding applied to livestock, poultry and aquatics, Karaj, Iran. (In Persian).

21- Melka, M. G, and F. S. Schenkel. 2010. Analysis of genetic diversity in four Canadian Swine breeds using pedigree data. Canadian Journal of Animal Science, 90(3): 331-340.

22- Meuwissen, T. I, and Z. Luo. 1992. Computing inbreeding coefficients in large populations. Genetics Selection Evolution, 24(4): 305–313.

23- Meyer, K. 2007. WOMBAT – A tool for mixed model analyses in quantitative genetics by REML. Journal of Zhejiang University-Science B, 8:815–821.

24- Mucha, S, and J. J. Windig. 2009. Effects of incomplete pedigree on genetic management of Dutch Landrace goat. Journal of Animal Breeding and Genetics, 126(3): 250-256.

25- Nadery Choploo, A., Sh. Ghoraishy., M. Rokouei, and M. Mansoori. 2012. Pedigree analysis of the closed nucleus of Iranian Markhoz goats. Pages 614-619 in Proc. 5th Congress on Animal Science, Isfahan, Iran. (In Persian).

26- Norberg, E, and A. C. Sorensen. 2007. Inbreeding trend and inbreeding depression in the Danish populations of Texel, Shropshire and Oxford Down. Journal of Animal Science, 85(2): 299–304.

27- Paiva, S. R., O. Faco., D. A. Faria., T. Lacerda., G. B. Barretto., P. L. S. Carneiro., R. N. B. Lobo, and C. McManus. 2011. Molecular and pedigree analysis applied to conservation of animal genetic resources: the case of Brazilian Somali hair sheep. Tropical Animal Health and Production, 43(7): 1449-1457.

28- Pedrosa, V. B., J. M. L. Santana., P. S. Oliveira., J. P. Eler, and J. B. S. Ferraz. 2010. Population structure and inbreeding effects on growth traits of Santa Inês sheep in Brazil. Small Ruminant Research, 93(2-3): 135–139.

29- Rashedi Dehsahraei, A., J. Fayazi, and M. Vatankhah. 2013. Investigating inbreeding trend and its impact on growth traits of Lori-Bakhtiari Sheep. Journal of Ruminant Research, 1: 65-78. (In Persian).

30- Rochambeau, H. C., F. Fournet-Hanocq, and J. V. T. Khang. 2000. Measuring and managing genetic variability in small populations. Annales de Zootechnie, 49(2): 77-93.

31- Sargolzaei, M., H. Iwaisaki, and J. J. Colleau. 2006. CFC: a tool for monitoring genetic diversity. Proceedings of the 8th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Belo Horizonte, Brazil.

32- Sheikhloo, M., M. Tahmoorespur, and A. A. Aslaminejad. 2012. A study of inbreeding of Baluchi Sheep in Abbas Abad breeding center of Mashhad. Iranian Journal of Animal Science Research, 3: 453-458. (In Persian).

33- Sheikhloo, M., M. Tahmoorespur, and A. A. Aslaminejad. 2013. Study of genetic variability of breeding flock of Makooyi sheep using pedigree analysis. Pages 1116-1120 in Proc. 1st National Conference on Livestock and Poultry Production in Northern Iran, Sari, Iran. (In Persian).

34- Tahmoorespour, M, and M. Sheikhloo. 2011. Pedigree analysis of the closed nucleus of Iranian Baluchi sheep. Small Ruminant Research, 99(1): 1–6.

35- Vatankhah, M., M. Moradi Shahrbabak., A. Nejati javarami., R. Miraei Ashtiani, and R. Vaez Torshizi. 2009. Determination of breeding objective and economic values for Lori-Bakhtiari breed of sheep in the village system. Animal Science Research, 82: 17-25. (In Persian).