بررسی تنوع ژنتیکی برخی ژنوتیپ‌های گردوی ایرانی در باغات تجاری مشهد با نشانگر ISSR

علوم باغبانی

مقاله 3، دوره 31، شماره 3، پاییز 1396، صفحه 611-620  

نوع مقاله: مقالات پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/jhorts4.v31i3.60521

نویسندگان

شادی عطار ¹؛ غلامحسین داوری نژاد¹؛ لیلا سمیعی²؛ محمد مقدم¹

¹دانشگاه فردوسی مشهد

²پژوهشکده علوم گیاهی، دانشگاه فردوسی مشهد

چکیده

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی تعدادی ژنوتیپ‌های گردوی ایرانی (Juglans regia L.) موجود در باغ‌های استان خراسان رضوی از نشانگر مولکولی ISSR استفاده گردید. با این هدف 56 ژنوتیپ گردو از باغ‌های استقلال، گلستان، الندشت و امام رضا انتخاب، پلاک‌کوبی و مورد آزمایش واقع شدند. با استفاده از 9 آغازگر مورد استفاده، در مجموع 118 باند تولید شد که در محدوده 300 تا 3000 جفت باز بود و 29 باند چند شکل بودند. تعداد قطعات تکثیر شده برای هر آغازگر متفاوت بود، به طوری که آغازگر 844 تعداد 14 عدد و آغازگر 890 تعداد 8 عدد باند تکثیر شده داشت. متوسط قطعات تکثیر شده برای هر آغازگر 83/9 بود. در دندوگرام حاصل از خوشه‌بندی ژنوتیپ‌ها بر اساس ضریب تشابه دایس و روش UPGMA 10 کلاستر تشکیل شد. میزان تنوع ژنتیکی در جمعیت مورد مطالعه پایین بود که دلایل عمده آن دخالت‌های انسانی، انتخاب و تکثیر تعداد معدودی از ژنوتیپ‌های برتر و گاها خود گرده افشانی گردو می‌باشد.

کلیدواژه‌ها

ارقام بومی؛ آغازگر؛ تشابه؛ جفت باز؛ کلاستر

مراجع

1- Aly M.M., Robert A., Fjellstrom G., McGranahan G.H. and Parfitt E. 1992. Origin of walnut somatic embryos determine by RFLP and Isozyme analysis. HortScience 27 (1): 61-63

2- Bayazit S., Kaza, K., Golbitti S., Cevik V., Ayanogla H., and Ergul A. 2007. AFLP analysis of genetic diversity in low chill requiring walnut (Juglans regia L.) genotyping from Hatay, Turkey. ScientiaHorticulturae. 111: 394-398

3- Christopoulos M. rouskas D. tsantili E. Bebeli P.J. 2010. Germplasm diversity and genetic relationships among walnut (Juglans regia L.) cultivars and Greek local selections revealed by Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) markers. Scientia Horticulturae 125(4):584-592

4- Dogan Y, Kafkas S, Sütyemez M, Akca Y, Türemis N, 2014. Assessment and characterization of genetic relationships of walnut (Juglans regia L.) genotypes by three types of molecular markers. Scientia Horticulturae 168 (2014) 81–87

5- Doyle, J.J. & Doyle, J.L. (1990). Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus,12, 13-15.

6- Fornari B., Canata F., Spada M. And Malvolti M. E. 1999. Alozyme analysis of genetic diversity differentiation in European and Asiatic walnut (Juglans regia L.) populations .Forest Genetics. 6(9): 115-127.

7- Fornari B., Malvolti M. E., Taurchini D.,Fineschi S., Beritognolo I., McCaglia E. And Cannata F. 2001. Isozym and organellar DNA analysis of genetic diversity in natural/naturalized European and Asiatic walnut (Juglans regia) populations. Acta Horticulturae. 544: 167-178

8- Foroni I., Woeste K., Monti L. M. and Rao R. 2006. Identification of ‘Sorrento’ walnut using simple sequence repeats (SSRs). Genetic Resources and Crop Evolution.85: 311-321

9- Haghjooyan R. 2002. Investigation of Toysarkan walnut genetic diversity and 4 walnut population in Iran with morphological and molecular markers. P.hD Thesis. Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran (In persian)

10- Jia XD Wang T, Zhai M, Li YR, Guo ZR.2011. Genetic diversity and identification of Chinese-grown pecan using ISSR and SSR markers. Molecules. 2011 Dec 6;16(12):10078-92

11- Ji A., Wang Y., Wu G., Wu W., Yang H., Wang Q. 2014. Genetic Diversity and Population Structure of North China Mountain Walnut Revealed by ISSR. American Journal of Plant Sciences, 2014 (5): 3194-3202

12- Mahmoodi R., Rahmani F., Rezayi R. 2011. Investigation of Genetic Diversity Some Persian walnut Genotypes With ISSR Molecular Marker. Seventh Conference of Biotechnology Islamic Republic of Iran. (In Persian with English abstract)

13- Malvolti M. Paciucci M. Cannata F, Fineschi S.1993. Genetic variation in Italian population of Juglans Regia. L. Acta horticulture 311.

14- Moradi M.H., Rostamzadeh J., Rashidi A., Vahabi KH., Karimi F., Ahmadi M. 2006. Investigation of Genetic Diversity With ISSR Molecular Marker. Conference findings Agriculture and Natural Resources (West Country) - Iran, Sanandaj -2006 (In Persian with English abstract)

15- Niceses F. P., Hormaza J. I. and McGranahan G. H. 1998. Molecul characterization and genetic relatedness among walnut (Juglans regia L.) genotypes based on RAPD markers. Euphytica 101:199-206

16- Orel G.,. Marchant A. D., McLeod J. A. and Richards G. D. 2003. Characterisation of 11 Juglandaceae genotypes based on morphology cpDNA and RAPD. HortScience. 38(6):1178-1183.

17- Pollegioni P., Bartoli S., Cannata F., Malvoti ME, 2003. Genetic differentiation of four Italian walnut varieties by inter simple sequence repeat. Journal of Genetics and Breeding, 57(3) : 231 - 240

18- Pollegioni P., Major A., Bartoli S., Ducci F., Proietti R., and Malvolti M.E. 2005. Application of microsattelite and dominant molecular markers for the discrimination of species and interspecific hybrids in genus Juglans. Acta Horticulturae, 705:191-197.

19- Potter D., Gao F., Aiello G., Leslie C. and McGranahan G. H. 2002. Intersimple sequence repeat markers for fingerprinting and determining genetic relationships of walnut (Juglans regia L.) cultivars. Journal of the American Society for Horticultural Science. 127:75-81.

20- Tian L., xiang A., Li-SI Z, Hai Rong W, Qing L. 2011. ISSR Analysis of Genetic Diversity among Seedling Walnut (Juglans spp.)Populations. Journal of Plant Genetic Resources 2011-04

21- Vahdati K. 2000 .Walnut situation in Iran. Nucis-Newsletter. 9: 32-33.

22- Vahdati K. Mohseni S. Karimi R, Barzehkar R. Amiri R.Mozaffari M. and Woeste K 2014. Genetic diversity and gene flow of some Persian walnut populations in southeast of Iran revealed by SSR markers. Plant Systematics and Evolution

23- Wang H., Pei D., Gu R., Wang, B.2008. Genetic Diversity and Structure of Walnut Populations in Central and Southwestern China Revealed by Microsatellite Markers. Journal of the American Society for Horticultural Science. 133(2):197–203. 2008.

24- Wani N., Bhat A., Ahmad F., Akhter S., Razvi M., and Mir M. 2010. Molecular markers and their application in walnut improvment. International Journal of Current Research . 3:006-011