بررسی چند شکلی ژن پومس(پرواپیوملانوکورتین) و ارتباط آن با صفات رشد درجوجه‌‌های گوشتی

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقاله 8، دوره 12، شماره 1 - شماره پیاپی 41، فروردین 1399، صفحه 103-112   

نوع مقاله: علمی پژوهشی- ژنتیک و اصلاح دام و طیور

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.v12i1.64015

نویسندگان

حجت جعفری زاده؛ محمد باقر منتظر تربتی^* ؛ سید همایون فرهنگ فر

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند، بیرجند، ایران

چکیده

پرواپیوملانوکورتین (پومس) یک پروتئین پیش ساز در جوجه­های گوشتی است که از 251 اسیدآمینه تشکیل شده است و در تنظیم غذای مصرفی و تعادل مصرف انرژی نقش دارد. هدف از انجام این پژوهش، تعیین چندشکلی ژن پرواپیوملانوکورتین و بررسی ارتباط آن با صفات رشد (که شامل وزن زنده، وزن لاشه، وزن سینه، وزن ران، وزن پشت وگردن، بال، کبد، قلب، بورس، طحال، پانکراس، پیش معده + سنگدان و چربی محوطه بطنی) در جوجه­های گوشتی سویه راس وکاب بود. بدین منظور از تعداد 100 قطعه جوجه گوشتی سویه راس و 60 قطعه جوجه گوشتی سویه کاب نمونه خون تهیه و استخراج DNA به­وسیله روش نمکی بهینه یافته صورت گرفت. پس از استخراج DNA، قطعه­ای به اندازه bp444 از ناحیه اگزون دوم ژن پرواپیوملانوکورتین با استفاده از تکنیک PCR تکثیر گردید. جهت تعیین ژنوتیپ نمونه­ها، از روش چندشکلی فرم فضایی رشته­های منفرد (SSCP) و الکتروفورز محصولات تک رشته­ای بر روی ژل پلی آکریل آمید و رنگ آمیزی توسط نیترات نقره انجام شد. برای ژن پرواپیوملانوکورتین در جوجه­های گوشتی سویه راس دو الگو بنام ­E و F و در جمعیت جوجه­های گوشتی سویه کاب نیز چهار الگوی A، B،C  و D مشاهده شد. ارتباط چندشکلی­ این ژن با صفات رشد به­وسیله رویه­ی GLM نرم افزار SAS آنالیز شد و نتایج نشان داد که در جوجه­های گوشتی سویه راس و کاب، قطعه 444 جفت بازی ژن پرواپیوملانوکورتین در جایگاه اگزون دوم دارای چند شکلی است. و هیچ یک از الگوهای مشاهده شده در ناحیه مورد مطالعه از ژن پرواپیوملانوکورتین، در هیچ کدام از دو جمعیت ­ارتباط معنی­داری با صفات رشد ندارند.

کلیدواژه‌ها

صفات رشد؛ ژن پرواپیوملانوکورتین؛ جوجه گوشتی؛ چندشکلی؛ PCR-SSCP

مراجع

Alinaghizadeh, H., M.R. Mohammad Abadi, and S. Zakizadeh. 2010. Exon 2 of BMP15 gene polymorphismin Jabal Barez Red Goat. Journal of Agricultural Biotechnology, 2 (1): 69-80. (In Persian).

2. Bai, Y., G. Sun., X. Kang., R. Han., Y. Tian., H. Li, and S. Zhu. 2012. Polymorphisms of the pro-opiomelanocortin and agouti-related protein genes and their association with chicken production traits. Journal of Molecular biology, 39(7): 7533-7539.

3. Benbouza, H., M. Jacquemin., J. Baudoin, and G. Mergeai. 2006. Optimization of a reliable fast cheap and sensitive silver staining method to detect SSR markers in polyacrylamide gel. Journal of Biotechnology Agronomy Society and Environment, 10: 77-81.

4. Cary, N.C. SAS Institute Inc. version 9.1.3: Administrator Guide for SAS 9.1.3 Foundation for Microsoft Windows 2003.

5. Dunnington, E.A., O. Gal, and Y. Plotsky. 1990. DNA fingerprints of chickens selected for high and low body weight for 31 generations. Journal of Animal Genetics, 21: 247-257.

6.Gu, Z., D. Zhu., N. Li., H. Li., X. Deng, and C. Wu. 2004. The single nucleotide polymorphisms of the chicken myostatin gene are associated with skeletal muscle and adipose growth. Journal of Science in China Life Science, 47: 26-31.

7. Iranpur, V, and M. A. K. Esmailizadeh. 2010. Rapid Extraction of High-Quality DNA from Whole Blood Stored at 4ºC‌‌ for Long Period. Protocol Online. http://www.protocol-online.org.

8. Javanmard, A., M.R. Mohammadabadi., G.E. Zarrigabayi., A.A. Gharahedaghi., M.R. Nassiry., A. Javadmansh, and N. Asadzadeh. 2008. Polymorphism within the intron region of the bovine leptin gene in Iranian Sarabi cattle (Iranian Bos taurus). Russian Journal of Genetics, 44 (4): 495-497.

9. Liu, Y., L. Zan., L. Li, and Y. Xin. 2013. Proopiomelanocortin gene polymorphisms and its association with meat quality traits by ultrasound measurement in Chinese cattle. Journal of Research Gate Gene, 529(1): 138-143.

10. Moazeni, S., M.R. Mohammadabadi., M. Sadeghi., H. Shahrbabak., A. Koshkoieh, and F. Bordbar. 2016. Association between UCP Gene Polymorphisms and Growth, Breeding Value of Growth and Reproductive Traits in Mazandaran Indigenous Chicken. Journal of Animal Sciences, 6 (1): 1-8.

11. Moazeni, S.M., M.R. Mohammadabadi., M. Sadeghi., H. Moradi Shahrbabak, and A.K. Esmailizadeh. 2016. Association of the melanocortin-3(MC3R) receptor gene with growth and reproductive traits in Mazandaran indigenous chicken. Journal of Livestock Science and Technologies, 4 (2): 51-56.

12. Mohammadi, A., M.R. Nassiry., J. Mosafer., M.R. Mohammadabadi,and G.E. Sulimova. 2009. Distribution of BoLA-DRB3 allelic frequencies and identification of a new allele in the Iranian cattle breed Sistani (Bos indicus). Russian journal of genetics, 45(2): 198-202.

13. Mohammadabadi, M.R., M. Nikbakhti., H. R. Mirzaee., A. Shandi., D. A. Saghi., M.N. Romanov, and I. G. Moiseyeva. 2010. Genetic variability in three native Iranian chicken populations of the Khorasan province based on microsatellite markers. Russian journal of genetics, 46 (4): 505-509.

14. Mohammadifar, A, and M.R. Mohammadabadi. 2011. Application of microsatellite markers for a study of Kermani sheep genome. Iranian journal of Animal Science, 42(4): 337-344. (In Persian).

15. Mousavizadeh, A., M.R. Mohammad Abadi., A. Torabi., M. R. Nassiry., H. Ghiasi, and A.K. Esmailizadeh. 2009. Genetic polymorphism at the growth hormone locus in Iranian Talli goats by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP). Iranian Journal of Biotechnology, 7 (1): 51-53.

16. Pavlidis, H. O. 2006. Do Gene Polymorphisms Associated with Feed Efficiency Influence Production Traits and Ascites Incidence in Broiler Crosses. ProQuest Information and Learning Company, 157-160.

17. Raffin-Sanson, M. L., Y. DeKeyzer, and X. Bertagna. 2003. Proopiomelanocortin a polypeptide precursor with multiple functions from physiology to pathological conditions. European Journal of Endocrinology, 149(2): 79-90.

18. Scully, K. M, and M. G. Rosenfeld. 2002. Pituitary development regulatory codes in mammalian organogenesis. Journal of Science Animal, 295(5563): 2231-2235.

19. Shahdadnejad, N., M.R. Mohammadabadi, and M. Shamsadini. 2016. Typing of Clostridium Perfringens Isolated from Broiler Chickens Using Multiplex PCR. Journal of Genetics in the 3rd millennium, 14 (4): 4368-4374.

20. Sharma, P., W. Bottje, and R. Okimoto. 2008. Polymorphisms in uncoupling protein, melanocortin 3 receptor, melanocortin 4 receptor, and pro-opiomelanocortin genes and association with production traits in a commercial broiler line. Journal of Poultry Science, 87(10): 2073-2086.

21. Shojaei, M., M.R. Mohammad Abadi., M. Asadi Fozi., O. Dayani., A. Khezri, and M. Akhondi. 2010. Association of growth trait and Leptin gene polymorphism in Kermani sheep. Journal of Cell and Molecular Research, 2: 67-73.

22. Takeuchi, S., K. Teshigawara, and S. Takahashi. 1999. Molecular cloning and characterization of the chicken pro-opiomelanocortin (POMC) gene. Journal of Biochimica et Biophysica Acta (BBA) Molecular Cell Research, 1450 (3): 452-459.

23. Wang, C. L., C. L. Meng., S. X. Cao., J. Zhang., C. H. Meng., H. L. Wang, and D. G. Mao. 2013. Single nuclear polymorphisms in exon 3 of POMC gene and the association with growth traits in Hu sheep and East Friesian x Hu crossbred sheep. journal of Yi chuan Hereditas Zhongguo yi chuan xue hui bian, 35(9):1095-1100.

24.Yang, Y. K, and C. M. Harmon.2003. Recent developments in our understanding of melanocortin system in the regulation of food intake. Journal of Obesity reviews, 4 (4): 239-248.

25. Zamani, P., M. Akhondi., M.R. Mohammadabadi., A.A. Saki., A. Ershadi., M.H. Banabazi, and A.R. Abdolmohammadi. 2013. Genetic variation of Mehraban sheep using two intersimple sequence repeat (ISSR) markers. African Journal of Biotechnology, 10: 1812-1817.

26. Zandi, E., M.R. Mohammadabadi., M. Ezzatkhah, and A.K. Esmailizadeh. 2014. Typing of Toxigenic Isolates of Clostridium Perfringens by Multiplex PCR in Ostrich. Iranian Journal of Applied Animal Science, 4: 509-514. (In Persian).

27. Zhang, C. L., Y. H. Wang., H. Chen., C. Z. Lei., X. T. Fang., J. Q. Wang, and J. Xiao. 2009. The polymorphism of bovine POMC gene and its association with the growth traits of Nanyang cattle. journal of Yi chuan Hereditas Zhongguo yi chuan xue hui bian, 31(12): 1221-1225.