تعداد نشریات | 49 |
تعداد شمارهها | 1,799 |
تعداد مقالات | 19,112 |
تعداد مشاهده مقاله | 8,412,596 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 5,738,435 |
بررسی اثر چند ریختی تک نوکلئوتیدیBIEC2-808543 ژن LCORL براندازه بدنی اسب عرب ایرانی | ||
پژوهشهای علوم دامی ایران | ||
مقاله 9، دوره 12، شماره 1 - شماره پیاپی 41، فروردین 1399، صفحه 125-133 اصل مقاله (755.63 K) | ||
نوع مقاله: علمی پژوهشی- ژنتیک و اصلاح دام و طیور | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.v12i1.78988 | ||
نویسندگان | ||
زیبا ابریشمی مقدم1؛ محسن میراسماعیلی1؛ مرتضی بیطرف ثانی* 2؛ مرتضی سیفتی3 | ||
1دانشگاه علم و هنر یزد | ||
2بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی یزد، سازمان تحقیقات ، آموزش و ترویج کشاورزی، یزد، ایران | ||
3گروه زیست شناسی، دکتری تخصصی ژنتیک، مرکز تحقیقات زیست فناوری پزشکی، واحد اشکذر، دانشگاه آزاد اسلامی ، اشکذر، یزد | ||
چکیده | ||
اندازه بدنی یکی از ویژگیهای مهم برای ارزیابی و دستهبندی اسبها میباشد. تجزیه و تحلیلهای انجام شده با مطالعات پویش کل ژنومی نشان داده است که اسنیپ (SNP) BIEC2-808543 یکی از مهمترین چند ریختی های تک نوکلئوتیدی مرتبط با ارتفاع و اندازه بدن اسبها است. در این مطالعه، تعیین ژنوتایپ BIEC2-808543 برای ۱۴۱نمونه اسب اصیل عرب به وسیله PCR-RFLP صورت گرفت. پس از استخراج DNA، واکنش زنجیرهای پلیمراز برای تکثیر قطعه ۲۸۴ جفت بازی در ژن LCORL انجام شد. محصول PCR تحت تاثیر آنزیم برشی Alu1 در واکنش PCR-RFLP برای تعیین ژنوتایپ نمونهها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان میدهد که الل T در اسب عرب تثبیت شده است و بر این اساس فقط یک اسب با ژنوتایپ CT یافت شد و بقیه دارای ژنوتیپ TT بودند. میزان FST برآورد شده حاکی از این است که توزیع فراوانی آللی و ژنوتیپی اسنیپ BIEC2-808543 در دو نوع اسب ردههای کورس و زیبایی یکسان میباشد. مقایسه امتیازات داوری، نشان داد که اختلاف معنیداری بین امتیاز دست و پا و گردن در بین اسبهای کورس و غیر کورس نمیباشد. در این مطالعه مشخص شد که اندازه دور قفسه سینه در اسبهای کورس بیشتر از اسبهای غیر کورس است و این اختلاف معنیدار بود. | ||
کلیدواژهها | ||
اسب عرب؛ اندازه بدنی؛ BIEC2-808543؛ LCORL | ||
مراجع | ||
- Baron, E., M. Lopes, D. Mendonca, and A. da Câmara Machado. 2012. SNP identification and polymorphism analysis in exon 2 of the horse myostatin gene. Animal Genetics, 43(2), 229-232.
2- Bruce, A., A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, and P. Walter. 2002. Molecular Biology of the Cell, 4th edition. New York: Garland Science. ISBN-10: 0-8153-3218-1ISBN-10: 0-8153-4072-9.
3- Felt, V. 2016. Genetic analysis of conformation traits in Icelandic horses with a focus on head morphology and body length.
4- Frischknecht, M., V. Jagannathan, P. Platte, M. Neuditschko, H. Signer-Hasler, I. Bachmann, and C. Flury. 2015. A non-synonymous HMGA2 variant decreases height in Shetland ponies and other small horses. PloS one, 10(10), e0140749.
5- He, S., L. Zhang, W. Li, and M. Liu. 2015. BIEC2-808543 SNP in the LCORL gene is associated with body conformation in the Yili horse. Animal biotechnology. 26(4),289-291.6- Makvandi-Nejad, S., et al. 2012. Four Loci Explain 83% of Size Variation in the Horse. PLoS ONE, 7(7): p. e39929.
7- Metzger, J., et al. 2013. Expression levels of LCORL are associated with body size in horses. PLoS One, 8(2): p. e56497.
8- Okuda, Y., H. H. Moe, K. K. Moe, Y. Shimizu, K. Nishioka, T. Shimogiri, and T. Kunieda. (2017). Genotype distribution and allele frequencies of the genes associated with body composition and locomotion traits in Myanmar native horses. Animal Science Journal, 88(8), 1198-1203.
9- Petersen, J. L., J. R. Mickelson, A. K. Rendahl, S. J. Valberg, L. S. Andersson, J. Axelsson, and A. S. Borges. 2013. Genome-wide analysis reveals selection for important traits in domestic horse breeds.PLoS Genetics, 9(1), e1003211.
10- Signer-Hasler, H., et al. 2013. A genome-wide association study reveals loci influencing height and other conformation traits in horses. PLoS One, 7(5): p. e37282.
11- Staiger, E. A., M. Al Abri, K. M. Pflug, S. Kalla, D. Ainsworth, D. Miller, and S. A. Brooks. 2016. Skeletal variation in Tennessee Walking Horses maps to the LCORL/NCAPG gene region. Physiological Genomics, 48(5), 325-335.
12- Tetens, J., P. Widmann, C. Kühn, and G. Thaller. 2013. A genome‐wide association study indicatesLCORL/NCAPG as a candidate locus for withers height in German Warmblood horses. AnimalGenetics, 44(4), 467-471.
13- Tozaki, T., et al. 2016. Sequence variants of BIEC2-808543 near LCORL are associated with body composition in Thoroughbreds under training. Journal of Equine Science, 27(3): p. 107.
14- Weir, Bruce S., and C. Clark Cockerham. 1984. "Estimating F‐statistics for the analysis of population structure." Evolution, 38(6):1358-1370. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 486 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 265 |