بازسازی شبکه ژن‌های هم‌بیان مرتبط با رشد و تکامل فولیکول‌های الیاف در جنین بز کرکی

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقاله 8، دوره 12، شماره 2 - شماره پیاپی 42، 1399، صفحه 231-240   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.v12i2.81710

نویسندگان

ارسلان برازنده¹؛ مرتضی مختاری¹؛ الهام بهدانی²؛ زهرا رودباری^{* 1}

¹گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران.

²دانشگاه دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین ، خوزستان، ایران.و منابع طبیعی رامین ، خوزستان

چکیده

فولیکول مو قسمتی از پوست است که مو را تولید و چرخه رشد مو را کنترل می‌کند. فولیکول مو مرکزی برای رشد الیاف مهم از نظر اقتصادی در صنعت دامپروری است. مطالعات نشان داده‌اند که تغییرات در سطح بیان ژن ها در رشد و نمو فولیکول مو تاثیر دارد. با وجود پیشرفت های اخیر در شناسایی شبکه های هم بیانی ژن ها و سیگنال های مولکولی که بر توسعه پوست و رشد فولیکول مو حاکم است، مکانیسم های تنظیم کننده ساخت الیاف بز کرکی، هنوز شناسایی نشده است. از این‌رو، پژوهش کنونی برای بررسی مهمترین مولکول­های کنترل کننده رشد و نمو فولیکول­های الیاف در بز کرکی و رمزگشایی ژن های درگیر در رشد و نمو فولیکول‌های الیاف انجام شد. به این منظور، از داده­های مربوط به توالی یابی رونوشت های پوست جنین بزهای کرکی شانبی در سه مرحله رشد استفاده شد. آنالیز بیان افتراقی رونوشت ها نشان داد که در تمام طول روند رشد فولیکول  بیان 145 ژن افزایش و بیان 650 ژن کاهش داشته است. از بین ژن‌هایی با بیان افتراقی، ژن­های تنظیمی هم بیان بر اساس نتایج واکاوی پارامترهای آماری شبکه و مستند سازی کارکردی شناسایی شدند که شامل: SHH، KLF4، MMP9،MSX1، KRT17 ، COL2A1و VEGFA بودند. بر اساس نتایج حاصل از پژوهش کنونی ژن هایی با اثرات عمده شناسایی شدند که تنظیم کننده شبکه‌های بیانی ژن ها و سیگنال‌های مولکولی مرتبط با ساخت الیاف بز کرکی هستند. این ژن ها با توجه به  مستند سازی عملکردی می توانند نقش قابل توجهی در بهبود اصلاح نژاد بز کرکی ایفا کنند.

کلیدواژه‌ها

آنالیز رونوشت؛ الیاف بز کرکی؛ بیان افتراقی؛ شبکه تنظیمی بیان

مراجع