شناسائی گونههای تریکودرما با استفاده از توالییابی جزئی ژنهای nrRNA و tef1α همراه با معرفی Trichoderma capillare برای میکوفلور ایران | ||
| پژوهش های حفاظت گیاهان ایران | ||
| مقاله 1، دوره 31، شماره 3 - شماره پیاپی 37، 1396، صفحه 362-373 اصل مقاله (725.31 K) | ||
| نوع مقاله: مقالات پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/jpp.v31i3.48738 | ||
| نویسندگان | ||
| مهدی مهرابی کوشکی* ؛ مریم باورساد؛ رضا فرخی نژاد | ||
| دانشگاه شهید چمران اهواز | ||
| چکیده | ||
| گونههای تریکودرما به فراوانی در خاکهای کشاورزی یافت میشوند و اغلب آنها بعنوان عامل بیوکنترلی علیه بیمارگرهای گیاهی عمل میکنند. آنها همچنین بعنوان تولیدکنندههای صنعتی آنزیمها شناخته میشوند. با توجه به اهمیت این قارچ، شناسائی صحیح آنها در سطح گونه ضروری میباشد. شناسائی گونهها مبتنی بر خصوصیات ریختشناسی با توجه به هموپلاسی زیاد در صفات ظاهری مناسب نمیباشد. در این تحقیق، 40 جدایه تریکودرما از استانهای اصفهان، اراک و همدان با استفاده از توالییابی جزئی ژنهای nrRNA و tef1α شناسائی شد. جدایهها در محیط PDB کشت شد و توده میسیلیومی با استفاده از کاغذ صافی جمعآوری شد. میسیلیومها در لیوفیلیزر خشک-انجمادی و سپس از آن استخراج DNA شد. واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت تکثیر حدود 550 و 900 جفت باز بترتیب از نواحی ITS و tef1α با استفاده از آغازگرهای عمومی و تخصصی انجام شد. قطعات تکثیری توالییابی شد و بعد از ویراستاری و جستجو با استفاده از الگوریتم BLASTn، در بانک ژن ذخیره گردید. بر اساس صفات ریختشناسی و آنالیز توالیهای نوکلئوتیدی ITS و tef1α، جدایهها در هفت گروه گونهای شامل Trichoderma harzianum، T. capillare ، T. pleuroticola، T. asperellum، T. koningiopsis، T. brevicompactum و T. virens توزیع شدند. درخت فیلوژنتیکی این جدایهها با استرینهای مرجع تیپ بر اساس توالی tef1α ترسیم شد که در آن خوشهبندی فیلوژنتیکی تولید شده اصالت گونهای جدایههای مورد بررسی را تأیید کرد. این اولین گزارش گونه T. capillare برای میکوفلور ایران است. | ||
| کلیدواژهها | ||
| DNA-بارکدینگ؛ خوشه بندی فیلوژنتیک؛ ریخت شناسی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 8,868 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,599 |
||