سبب‌شناسی و انتقال فیتوپلاسمای همراه با فیلودی لوبیا چشم بلبلی از استان آذربایجان شرقی

پژوهش های حفاظت گیاهان ایران

مقاله 1، دوره 32، شماره 2 - شماره پیاپی 40، شهریور 1397، صفحه 185-193   

نوع مقاله: مقالات پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/jpp.v32i2.71083

نویسندگان

سارا قارونی کاردانی^* ؛ الهام جمشیدی

دانشگاه فردوسی مشهد

چکیده

در بررسی‌های انجام شده از مزارع لوبیا چشم بلبلی (Vigna unguiculata) استان آذربایجان شرقی در تابستان 1395، در برخی از بوته‌ها علائم ریز برگی، خشبی شدن برگ‌ها، فیلودی گل‌ها، ضخیم شدن و کتابی شدن ساقه، ازدیاد جوانه و کوتولگی بوته مشاهده شد. در گلخانه عامل بیماری به وسیله سس به پروانش انتقال داده شد و در پروانش مایه‌زنی شده علائم گل سبزی، برگسانی و کاهش فاصله میانگره‌ها ظاهر گردید. با استفاده از آغازگرهای عمومیP1/P7 و آغازگرهای آشیانه‌ای R16F2n/R16R2 در واکنش زنجیره‌ای پلی مراز (پی سی آر) از کلیه نمونه‌های دارای علائم قطعات 1830 جفت باز در پی سی آر عمومی و 1245 جفت باز در پی سی آر آشیانه‌ای تکثیر شد. در حالی‌که در نمونه‌های گیاهان سالم، قطعه‌ای تکثیر نگردید. محصول واکنش زنجیره‌ای پلی مراز پس از همسانه‌سازی، تعیین ترادف گردید. جستجو با برنامه Blast، آنالیز فیلوژنتیکی و بررسی چند شکلی طولی قطعات برشی (RFLP) محصول پی سی آر دو مرحله‌ای، با آنزیم‌های برشی HinfI, RsaI, AluI, TaqI, HpaII و مقایسه نقوش حاصله نشان داد که فیتوپلاسمای همراه با فیلودی لوبیا چشم بلبلی بیشترین نزدیکی را با اعضای گروه افژولش شبدر (Clover proliferation group, 16SrVI) دارد. همچنین آنالیز توالی‌ها با استفاده از نرم‌افزار iPhyClassifier و انجام RFLP مجازی با استفاده از 17 آنزیم برشی، علاوه بر تأیید نتایج آنالیزهای RFLP فیزیکی و تبارزایی نشان داد که فیتوپلاسمای مورد بررسی در گروه 16SrVI-A (با ضریب تشابه 1) قرار می‌گیرد.

کلیدواژه‌ها

آنالیز فیلوژنتیکی؛ چند شکلی طولی قطعات برشی؛ فیتوپلاسما؛ لوبیا چشم بلبلی

مراجع

1- Bertaccini A., Duduk B., Paltrinieri S., and Contaldo N. 2014. Phytoplasmas and phytoplasma diseases: a severe threat to agriculture. America Journal of Plant Science, 5:1763-1788.

2- De La Rue S., Padovan J., and Gibb K. 2001. Stylosanthes is a host for several phytoplasmas, one of which shows unique 16S 23S intergenic spacer region heterogeneity. Journal of Phytopathology, 149, 613–619.

3- Deeley J.W., Stevens A., and Fox R.T.V. 1979. Use of Dienes'stain to detect plant diseases induced by mycoplasma like organisms. Phytopathology, 69:1169-1171.

4- Esmailzadeh Hosseini S.A., Salehi M., Mirchenari S.M., Tarizeh D., and Gholampoor H. 2015. First report of a 16SrVI group related phytoplasma associated with cucumber phyllody in a greenhouse in Iran. New Disease Report, 32:35.

5- Fattahi M., Salehi M., Sharzehi A., and Esmailzadeh Hosseini S.A. 2016. Partial biological and molecular characteristics of a phytoplasma associated with Behshahr (Mazandaran) periwinkle phyllody. Iranian Journal of Plant Pathology 52(1), Pages 135-141. (In Persian with English abstract).

6- Gharouni Kardani S., and Jamshidi E. 2018. First report of 16SrVI group phytoplasma on cucumber (Cucumis sativus) in North Khorasan province of Iran. International conference on Agricaltural Science, Medicinal Plants and Traditional medicine. Mashhad. Iran (In Persian with English abstract).

7- Hosseini P., Bahar M., Madani G., and Zirak L. 2011. Molecular Characterization of a Phytoplasma Associated with Potato Witches-broom Disease in Iran. Journal of Phytopathology, 159:120–123.

8- Jamshidi E., Jafarpour B., Rouhani H., and Salehi M. 2014. Association of members of clover proliferation (16SrVI) and pigeon pea witches’broom (16SrIX) phytoplasma groups with tomato big bud disease in Iran. Iranian Journal of Plant Pathology, 50:79-89.

9- Kumar S., Singh V., and Lakhanpaul S. 2012. A 'Candidatus Phytoplasma asteris' isolate associated with bud proliferation disease of cowpea in India. New Disease Reports, 25, 28.

10- Kumar S., Stecher G., and Tamura K. 2016. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution, 33:1870-1874.

11- Lee I.M., Hammond R.W., Davis R.E., and Gundersen D.E. 1993. Universal amplification and analysis of pathogen 16S rDNA for classification and identification of mycoplasma like organisms. Phytopathology, 83: 834-842.

12- Lee I.M., Gundersen-Rindal D. E., Davis R. E., and Bartoszyk I. M. 1998. Revised classification scheme of phytoplasmas based on RFLP analyses of 16S rRNA and ribosomal protein gene sequences. International Journal of Systematic Bacteriology, 48: 1153-1169.

13- Lee I.M., Davis R.E., and Gundersen-Rindal D.E. 2000. Phytoplasma: phytopathogenic mollicutes. Annual Review of Microbiology, 54, 221–55.

14- Lee I.M., Bottner K.D., Miklas P.N., and Pastor-Corrales M.A. 2004. Clover proliferation group (16SrVI) subgroup A (16SrVI-A) phytoplasma is a probable causal agent of dry bean phyllody disease in Washington. Plant Disease, 88:429.

15- Rao G.P., Madhupriya Kumar M., Tomar S., Maya B., Singh S. K., and Johnson J.M. 2018. Detection and identification of four 16Sr subgroups of phytoplasmas associated with different legume crops in India. European Journal of Plant Pathology, 150: 507-513.

16- Salehi E., Salehi M., and Masoumi M. 2016. Biological and molecular characterization of the phytoplasma associated with tomato big bud disease in Zanjan province, Iran. Iranian Journal of Plant Pathology, 52 (3):415-427. (In Persian with English abstract).

17- Salehi M., Izadpanah K., and Siampour M. 2007. Characterization of a phytoplasma associated with cabbage yellows in Iran. Plant Disease, 91: 625-630.

18- Saqib M., Bayliss K.L., and Jones M.G.K. 2006. Identification of sweet potato little leaf phytoplasma associated with Vigna unguiculata Var. sesquipedalis and Lycopersicon esculentum. Australasian Plant Pathology, 35, 293–296.

19- Schneider B., Seemuller E., Smart C.D., and Kirkpatrick B.C. 1995. Phylogenetic classification of plant pathogenic mycoplasma-like organisms or phytoplasmas. In: Razin S, Tully JG. (eds) Molecular and diagnostics procedures in Mycoplasmology, Vol I. San Diego, CA, Academic Press, pp 369–380.

20- Thorat V., Bhale U., Sawant V., More V., Jadhav P., Mane S.S., Nandanwar R.S., Tripathi S., and Yadav A. 2016. Alternative weed hosts harbors 16SrII group phytoplasmas associated with little leaf and witches’ broom diseases of various crops in India. Phytopathogenic Mollicutes, 6(1), 50–55.

21- Wei W., Lee I.M., Davis R.E., Suo X., and Zhao Y. 2007c. Virtual RFLP analysis of 16S rDNA sequences identifies new subgroups in the clover proliferation phytoplasma group. Bulletin of Insectology, 60:349-350.

22- Weintraub P.G., Jones P., (eds). 2010. Phytoplasmas: Genomes, Plant Hosts and Vectors CAB International. 348 pages.

23- Zhang Y.P., Uyemoto J.K., Kirkpatrick B.C. 1998. A small-scale procedure for extracting nucleic acids from woody plants infected with various phytopathogens for PCR assay. Virology Method, 71: 45-50.

24- Zhao Y., Wei W., Lee I.M., Shao J.X., and Davis R.E. 2009. Construction of an interactive online phytoplasma classification tool, iPhyClassifier, and its application in analysis of the peach X-disease phytoplasma group (16SrIII). International Journal of Systemic and Evolutionary Microbiology, 59: 2582-2593.

25- Zibadoost S., Rastgou M., Asghari S., Tazehkand S.A. 2016. Detection and molecular identification of ‘Candidatus phytoplasma trifoli’ infecting some cultivated crops and vegetables in West Azarbaijan province. Australasian Plant Disease Notes, 11: 3.