بررسی اثر پرسپترون چند لایه در صحت انتخاب ژن های میکرو RNA کرم ابریشم (Bombyx mori L)

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 0-727 فروردین 2  

نوع مقاله: علمی پژوهشی- ژنتیک و اصلاح دام و طیور

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.2020.38276.0

نویسنده

عاطفه سیددخت

دانشگاه فردوسی مشهد

چکیده

میکرو RNA ها خانواده ای گسترده از مولکول هایRNA  کوتاه غیر کد کننده پروتئینی (ncRNA) و دارای وظایفی مهم در تنظیم فرآیندهای رشد در گیاهان و حیوانات هستند. مطالعات اندکی در ارتباط با میکرو RNA های کرم ابریشم که از نظر اقتصادی بسیار مهم نیز هستند، با تمرکز بر شناسایی، آنالیز بیان و پیش بینی عملکرد انجام شده است. به طور کلی توالی میکرو RNA ها در سرتاسر گونه ها بسیار محافظت شده است و از ساختار ساقه-حلقه اولیه در هسته که از ویژگی های بسیار مهم میکرو RNA ها هستند، تولید می شوند. میکرو RNA ها از مهمترین عوامل تنظیمی دخیل در سطوح پس از رونویسی پس از بیان ژن هستند که در تعدیل تعداد زیادی از فرآیندهای فیزیولوژیکی مانند رشد و نمو، متابولیسم و وقوع بیماری ها مشارکت می کنند. با اینکه صدها میکرو RNA در گونه های مختلف شناسایی شده اند، تعداد خیلی زیادی هنوز هم ناشناخته باقی مانده اند. بنابراین کشف ژن های جدید میکرو RNA یک گام مهم برای درک میکرو RNA هایی است که مکانیسم های تنظیم پس از رونویسی را واسطه گری می کنند. روش های بیولوژیکی برای شناسایی ژن های میکرو RNA ممکن است در شناسایی تشخیص میکرو RNA های نادر محدودیت داشته باشند و بیشتر محدود به بافت های خاص و مراحل رشد و نموی ارگانیسم تحت آزمایش می شوند. این محدودیت ها منجر به پیشرفت روش های محاسباتی پیشرفته برای شناسایی میکرو RNA های احتمالی جدید شده است. استفاده از روش های محاسباتی باعث افزایش دقت در شناسایی میکرو RNA های کرم ابریشم خواهد شد. در این پژوهش به طور موفقیت آمیزی یک مدل کلاس بندی کننده مؤثر با استفاده از روش های یادگیری ماشینی ارائه شده است. روش ما شامل معرفی داده های نماینده تر، استخراج ویژگی های بیولوژیکی مؤثر و ارزیابی کامل عملکرد طبقه بندی گر از طریق اعتبارسنجی متقاطع است.

مراجع