بررسی اثر مهاری پپتید CLF36 مشتق شده از لاکتوفرین شتری بر مسیر پیامرسان NF-кB در محیط شبیهسازی شده مولکولی (In silico) | ||
| پژوهشهای علوم دامی ایران | ||
| مقاله 11، دوره 15، شماره 2 - شماره پیاپی 54، تابستان 1402، صفحه 285-297 اصل مقاله (1.38 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.2023.78545.1100 | ||
| نویسندگان | ||
| حجت الله یامی1؛ مجتبی طهمورث پور* 2؛ محمدهادی سخاوتی2؛ علی جوادمنش2 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی،دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. | ||
| 2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. | ||
| چکیده | ||
| هدف از این مطالعه، بررسی اثرات مهاری لاکتوفرامپین- لاکتوفریسین شتری نوترکیب بر مسیر فاکتور هستهای کاپا B (NF-кB) بود. این پپتید (CLF36) که با مطالعه قبلی در آزمایشگاه بیوتکنولوژی گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد (شماره دسترسی بانک ژن: MH327768.1) تهیه شده است. اثرات بازدارندگی این پپتید با شبیهسازی داکینگ مولکولی (In silico) ارزیابی شد. دادههای پروتئین برای مسیر پیامرسان NF-кB از بانک دادههای پروتئین (PDB) و UniProt جمعآوری شد. سپس، شبیهسازی برهمکنش (داکینگ) پپتید CLF36 با مسیر پیامرسان NF-кB در بالادست، سایتوکینهای پیشالتهابی (مانند TNF-α و IL-6) و در پاییندست، IKK-β وNF-κB-p65 سیتوپلاسمی با استفاده از نرمافزار آنلاین ClusPro 2.0انجام شد. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی بر اساس برهمکنشهای مولکولی این پپتید با جایگاه فعال پروتئینهای مسیر NF-кB نشان داد که ممکن است نقش تعدیلکنندگی و ضدالتهابی در فرآیندهای ایمنی را با اثر مهاری بر روی سایتوکینهای TNF-α و IL-6 در بالادست و IKK-β و NF-κB-p65 در پایین دست مسیر پیامرسان NF-кB داشته باشد. این نتایج مشابه با اثرات مهاری Infliximab،Camelid Fab، NEMO و GILZ بر روی مسیر پیامرسان NF-кB است. علاوهبراین، این یافتهها ممکن است یک مبنای نظری برای مکانیسمهای درمانی پپتید CLF36 فراهم کند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| سایتوکینهای پیشالتهابی؛ شبیهسازی داکینگ مولکولی؛ مسیر فاکتور هستهای کاپا B | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 9,228 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,109 |
||