شناسایی نشانه‌های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقاله 11، دوره 15، شماره 3 - شماره پیاپی 55، پاییز 1402، صفحه 463-473   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.2023.80444.1120

نویسندگان

حسین محمّدی^{* 1}؛ محمد شمس اللهی²

¹گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

²گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

چکیده

پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون (JD) یکی از بیماری­های مهم مزمن التهاب روده­ای در نشخوارکنندگان است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی نشانه­های انتخاب با استفاده از آماره ناِاُریب تتا مرتبط با مقاومت به بیماری یون در دو نژاد بز جانیکا و سیریانا می­باشد. به این منظور، مجموع 331 حیوان برای 53345 جایگاه نشانگری SNP با استفاده از تراشه­های Caprine SNP50 BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت داده­های اولیه در نهایت، 51182 نشانگر SNP و 326 رأس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده بر اساس آزمون آنتی­بادی سرم خون (الایزا) در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (162) و بیمار (164) گروه­بندی شدند. با در نظر گرفتن صدک 9/99 کل ارزش­های تتا، سیزده ناحیه ژنومی در نژاد جانیکا روی کروموزوم­های 1، 5، 7 (دو منطقه)، 8، 9 (دو منطقه)، 11، 16، 17، 18 و 20 (دو منطقه) شناسایی شدند. همچنین، در نژاد سیریانا نواحی ژنومی روی کروموزوم­های 3، 5 (دو منطقه)، 10، 12، 16، 17، 18، 23، 24 و 29 بالاتر از این دامنه بودند، شناسایی شدند. بررسی ژن­های گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژن­های IL4، IL13، TLR2، TLR4، IFNGR1، PGLYRP1، CHI3L2، PPFIBP1 و DENND5B قرار داشتند. بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد، ژن­های موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، مقاومت به بیماری و عفونت باکتریایی، پاسخ به استرس اکسیداتیو و سرکوب سرطان مرتبط هستند. نتایج این تحقیق می­تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه، ژن­های مرتبط با بیماری یون در نژادهای مختلف بز فراهم آورد.

کلیدواژه‌ها

آماره تتا؛ بیماری یون؛ سیستم ایمنی؛ سیگنال‌های انتخاب

مراجع