شناسایی نشانه‌های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 20 اسفند 1401   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.2023.80444.1120

نویسندگان

حسین محمّدی^{* 1}؛ محمد شمس اللهی²

¹گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

²گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

چکیده

پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون (JD) یکی از بیماری‌های مهم مزمن التهاب روده‌ای در نشخوارکنندگان است. هدف پژوهش حاضر شناسایی نشانه‌های انتخاب با استفاده از آماره ناِاُریب تتا مرتبط با مقاومت به بیماری یون در دو نژاد بز جانیکا و سیریانا می‌باشد. به این منظور مجموع 331 حیوان برای 53345 جایگاه نشانگری SNP با استفاده از تراشه-هایCaprine SNP50 BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت داده‌های اولیه در نهایت 51182 نشانگر SNP و 326 رأس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده براساس آزمون آنتی‌بادی سرم خون (الآیزا) در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (162) و بیمار (164) گروه‌بندی شدند. با در نظر گرفتن صدک 9/99 کل ارزش‌های تتا، سیزده ناحیه ژنومی در نژاد جانیکا روی کروموزوم‌های 1، 5، 7 (دو منطقه)، 8، 9 (دو منطقه)، 11، 16، 17، 18 و 20 (دو منطقه) شناسایی شدند. همچنین در نژاد سیریانا نواحی ژنومی روی کروموزوم‌های 3، 5 (دو منطقه)، 10، 12، 16، 17، 18، 23، 24 و 29 بالاتر از این دامنه بودند، شناسایی شدند. بررسی ژن‌های گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژن‌های IL4، IL13، TLR2، TLR4، IFNGR1، PGLYRP1، CHI3L2، PPFIBP1 و DENND5B قرار داشتند. بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد، ژن‌های موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، مقاومت به بیماری و عفونت باکتریایی، پاسخ به استرس اکسیداتیو و سرکوب سرطان مرتبط هستند. نتایج این تحقیق می‌تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه ژن‌های مرتبط با بیماری یون در نژادهای مختلف بز فراهم آورد.

کلیدواژه‌ها

آماره تتا؛ بیماری یون؛ سیستم ایمنی؛ سیگنال‌های انتخاب

مراجع