پویش ژنومی بر پایه آنالیز چند جمعیتی مشترک مرتبط با صفت تعداد نتاج متولد شده در گوسفندان نژاد بومی و خارجی

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقاله 7، دوره 16، شماره 2 - شماره پیاپی 58، تابستان 1403، صفحه 249-258   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.2023.83596.1164

نویسنده

حسین محمّدی^*

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

چکیده

تعداد بره متولد شده در هر زایش یکی از مهم‌ترین صفات اقتصادی و تولیدمثلی در گوسفند است. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی مناطق ژنومی و ژن­های کاندیدای مرتبط با چندقلوزایی در نژادهای مختلف گوسفند با رویکرد مگاآنالیز پویش ژنومی از طریق استفاده از اطلاعات مربوط به سه نژاد زندی، راهمنی و کایاس می­باشد. بدین منظور، از اطلاعات ژنوتیپی و فنوتیپی 682 رأس دام شامل نژادهای زندی (96)، راهمنی (48) و کایاس (538) تعیین ژنوتیپ شده با از آرایه­های 50K گوسفندی، استفاده شد. پس از مراحل مختلف کنترل کیفیت و ادغام داده­های تعیین ژنوتیپ شده، 671 رأس دام و 45167 نشانگر SNP برای ادامه آنالیزهای پویش ژنومی مورد استفاده قرار گرفتند. مگاآنالیز با استفاده از مدل خطی مختلط در نرم­افزار TASSEL با در نظر گرفتن روابط خویشاوندی و ساختار جمعیتی انجام شد. نتایج حاصل نشان داد که تعداد نه نشانگر روی کروموزوم­های شماره 1 (دو نشانگر)، 2، 3 (دو نشانگر)، 10، 13 (دو نشانگر) و 22 به‌طور معنی­داری با صفت چندقلوزایی مرتبط می­باشند. بررسی مناطق ژنومی کاندیدا به‌وسیله پایگاه­های داده­ای برخط نشان داد ژن­های کاندیدای DLG1، CLSTN2، INHBE­، TCFL5 و RBP4 نقش مؤثری در باروری، آبستنی موفق، فرآیند آزادسازی تخمک و اوولاسیون دارند. نتایج این پژوهش می­تواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترل‌کننده چندقلوزایی در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه‌ها

آنالیز پیوستگی؛ بهبود باروری؛ مگاآنالیز؛ ناحیه ژنومی؛ نشانگر ژنتیکی

مراجع