پویش کل ژنومی بر پایه مگاآنالیز مرتبط با صفت تعداد بره متولد شده در گوسفندان نژاد بومی و خارجی

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 29 مهر 1402   

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.2023.83596.1164

نویسنده

حسین محمّدی^*

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

چکیده

تعداد بره متولد شده در هر زایش یکی از مهم‌ترین صفات اقتصادی و تولیدمثلی در گوسفند است. هدف از پژوهش حاضر شناسایی مناطق ژنومی و ژن‌های کاندیدای مرتبط با چندقلوزایی در نژادهای مختلف گوسفند با رویکرد مگاآنالیز پویش ژنومی از طریق استفاده از اطلاعات مربوط به سه نژاد زندی، راهمنی و کایاس می‌باشد. بدین منظور از اطلاعات ژنوتیپی و فنوتیپی 682 رأس دام شامل نژادهای زندی (96)، راهمنی (48) و کایاس (538) تعیین ژنوتیپ شده با از آرایه‌های 50K گوسفندی، استفاده شد. پس از مراحل مختلف کنترل کیفیت و ادغام داده‌های تعیین ژنوتیپ شده، 671 رأس دام و 45167 نشانگر SNP برای ادامه آنالیزهای پویش ژنومی مورد استفاده قرار گرفتند. مگاآنالیز با استفاده از مدل خطی مختلط در نرم‌افزار TASSEL با در نظر گرفتن روابط خویشاوندی و ساختار جمعیتی انجام شد. نتایج حاصل نشان داد تعداد نه نشانگر روی کروموزوم‌های شماره 1 (دو نشانگر)، 2، 3 (دو نشانگر)، 10، 13 (دو نشانگر) و 22 به طور معنی‌داری با صفت چندقلوزایی مرتبط می‌باشند. بررسی مناطق ژنومی کاندیدا بوسیله پایگاه‌های داده‌ای برخط نشان داد ژن‌های کاندیدای DLG1، CLSTN2، INHBE‌، TCFL5 و RBP4 نقش مؤثری در باروری، آبستنی موفق، فرآیند آزاد سازی تخمک و اوولاسیون دارند. نتایج این پژوهش می‌تواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترل کننده چندقلوزایی در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه‌ها

چند جمعیتی؛ چندقلوزایی؛ ژن کاندیدا؛ گوسفند؛ نشانگر چندشکلی تک نوکلئوتیدی

مراجع