تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی و فیلوژنتیکی ژن COX3 میتوکندری شترهای تک کوهانه و دوکوهانه ایران

پژوهشهای علوم دامی ایران

مقاله 12، دوره 8، شماره 2 - شماره پیاپی 26، تابستان 1395، صفحه 361-369   

نوع مقاله: علمی پژوهشی- ژنتیک و اصلاح دام و طیور

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/ijasr.v8i2.36720

نویسندگان

طوبی عباسی دلویی^{* 1}؛ محمدهادی سخاوتی²؛ مجتبی طهمورث پور³

¹دانشگاه فردوسی

²گروه علوم دامی، دانشکده کشـاورزی، دانشـگاه فردوسـی مشهد، مشهد، ایران

³گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.

چکیده

نژادهای بومی ایران بخشی از سرمایه ملی تلقی، بنابراین حفظ آن ها اهمیت ویژه ای دارد. توجه بیشتر به این نژادها از دیدگاه ژنتیک حفاظتی با توجه به کاهش شدید جمعیت آن ها در برخی مناطق، از اهمیت زیادی برخوردار است. هدف از انجام این مطالعه، بررسی بیوانفورماتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی زیرواحد 3 کمپلکس سیتوکروم اکسیداز (COX3) میتوکندری در شترهای تک کوهانه و دوکوهانه ایرانی بود. برای این منظور 10 نمونه خون از هر یک از این دو گونه جمع آوری شد (20 نمونه). پس از استخراج DNA، قطعه 979 جفت بازی از ژنوم میتوکندریایی با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز تکثیر گردید. توالی‌یابی با روش اتوماتیک سانگر صورت گرفت و سپس توالی های بدست آمده با توالی‌های حاصل از مطالعات دیگر، مقایسه شدند. نتایج به دست آمده نشان داد که هیچ تفاوت نوکلئوتیدی بین توالی COX3 نمونه های مختلف تک کوهانه و نمونه های مختلف دوکوهانه ایرانی وجود نداشته و همچنین توالی های نوکلئوتیدی در این دو گونه به ترتیب با شتر تک کوهانه (شتر عربی) با شماره دسترسی NC_009849 و شتر دوکوهانه (شتر باختری) با شماره دسترسی NC_009628، همولوژی 100 درصد دارند. مقایسه توالی های نوکلئوتیدی و اسیدآمینه ای و همچنین ساختار سه بعدی COX3 در گونه های شتر ایرانی نشان داد که این دو گونه دارای فاصله ژنتیکی نزدیکی هستند. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی مشخص کرد که این دو گونه در میان خانواده شترسانان، با Lama guanicoe کمترین قرابت را دارند.

کلیدواژه‌ها

شتر دوکوهانه؛ شتر تک کوهانه؛ COX3؛ DNA میتوکندریایی

مراجع