بررسی تنوع کمیت ژنومی (C-value) و سطح پلوئیدی در تعدادی از ارقام سیب بومی به روش فلوسایتومتری

علوم باغبانی

مقاله 1، دوره 30، شماره 4، اسفند 1395، صفحه 694-700   

نوع مقاله: مقالات پژوهشی

شناسه دیجیتال (DOI): 10.22067/jhorts4.v0i0.43387

نویسندگان

شاداب فرامرزی^{* 1}؛ عباس یداللهی²؛ قاسم کریم زاده²

¹دانشگاه هرمزگان

²دانشگاه تربیت مدرس

چکیده

علیرغم تنوع زیاد ارقام و گونه‌های سیب در ایران، هنوز بانک اطلاعاتی در مورد وضعیت پلوئیدی و اندازه ژنوم آنها وجود ندارد. در این تحقیق، مقدار DNA ژنومی و سطح پلوئیدی تعدادی از ارقام و ژنوتیپ‌های سیب ایرانی با دستگاه فلوسایتومتری و به روش رنگ‌آمیزی با پروپیدیوم یدید در قالب طرح کاملاً تصادفی بررسی شد. همچنین، تاثیرPVP به عنوان یک بازدارنده اکسیداسیون ترکیبات فنلی روی اندازه ژنوم این سیب‌ها به صورت فاکتوریل و در قالب طرح کاملاً تصادفی آزمایش شد. نتایج نشان داد که همه‌ی ارقام مطالعه شده، دیپلوئید هستند و اندازه ژنوم تخمین زده شده در آنها بین 73/1 تا 57/1 پیکوگرم در هر هسته سلولی متغیر بود. تیمار PVP روی تخمین اندازه ژنوم در سطح احتمال 5 درصد معنی‌داری نشان داد.

کلیدواژه‌ها

ارقام بومی؛ اندازه ژنوم؛ تنوع ژنتیکی؛ ژرم پلاسم

مراجع

1- Alizadeh A. 2008. Identification, collection and morphological analysis Iranian apple germplasmReport of research work (in Persian).

2-Bennett M.D., and Smith J. 1976. Nuclear DNA amounts in angiosperms. Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences, 274: 227-274.

3- Doležel J., Bartos J., Voglmayr H., and Greilhuber J. 2003. Nuclear DNA content and genome size of trout and human. Cytometry. Part A: Journal of the International Society for Analytical Cytology, 51(2): 127.

4- Doležel J., Greilhuber J., and Suda J. 2007. Estimation of nuclear DNA content in plants using flow cytometry. Nature Protocols, 2(9): 2233-2244.

5-Faramarzi S., Yadollahi A.,Barzegar M., Sadraei K., Pacifico S., and Jemric T. 2014. Comparison of Phenolic Compounds’ Content and Antioxidant Activity between Some Native Iranian Apples and Standard Cultivar 'Gala'. Journal of Agricultural Science and Technology, 16: 1601-1611.

6- Gonai T., Manabe T., Inoue E., Hayashi M., Yamamoto T., Hayashi T., Sakuma F., and Kasumi M. 2006. Overcoming hybrid lethality in a cross between Japanese pear and apple using gamma irradiation and confirmation of hybrid status using flow cytometry and SSR markers. Scientia horticulturae, 109: 43-47.

7- Gustafson P., Korban S., Wannarat W., Rayburn C.M., Tatum T.C., and Rayburn A.L.2009. Genome size and nucleotypic variation in Malus germplasm. Genome, 52: 148-155.

8- Harris S.A., Robinson J.P., and Juniper B.E. 2002. Genetic clues to the origin of the apple. Trends in Genetics, 18(8): 426-430.

9- Höfer M., and Meister A. 2010. Genome size variation in Malus species. Journal of Botany, 2010.

10- Jedrzejczyk I., and Sliwinska E. 2010. Leaves and seeds as materials for flow cytometric estimation of the genome size of 11 Rosaceae woody species containing DNA-staining inhibitors. Journal of Botany, 2010.

11- Juniper B., Watkins R., and Harris S. 1998. The origins of the apple. Acta Horticulturae, 484: 27–33.

12- Kindersley D. 2008. RHS AZ Encyclopedia of GAErden Plants UK, p. 1136.

13- Korban S., and Skirvin R. 1984. Nomenclature of the cultivated apple. Hort Science, 19: 177-180.

14- Laurie D., and Bennett M.1986. Wheat× maize hybridization. Canadian Journal of Genetics and Cytology, 28: 313-316.

15- Pellicer J., and Leitch I. 2014. The Application of Flow Cytometry for Estimating Genome Size and Ploidy Level in Plants. Pascale Besse (ed.), Molecular Plant Taxonomy: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology. Springer Science+Business Media, New York.

16- Phipps J.B., Robertson K.R., Smith P.G., and Rohrer J.R. 1990. A checklist of the subfamily Maloideae (Rosaceae). Canadian Journal of Botany, 68: 2209-2269.

17- Phipps J.B., Robertson K.R., Rohrer J.R., and Smith P.G.1991. Origins and evolution of subfam. Maloideae (Rosaceae). Systematic Botany, 303-332.

18- Rayburn A.L., Price H.J., Smith J., and Gold J.R. 1985. C-band heterochromatin and DNA content in Zea mays. American Journal of Botany, 1610-1617.

19- Tatum T.C., Stepanovic S., Biradar D., Rayburn A.L., and Korban S.S. 2005. Variation in nuclear DNA content in Malus species and cultivated apples. Genome, 48: 924-930.

20- Way R., Aldwinckle H., Lamb R., Rejman A., Sansavini S., Shen T., Watkins R., Westwood M.N., and Yoshida Y. 1990. Apples (Malus). Acta Horticulturae, 290: 3–62.

21- YokoyaK., Roberts A., Mottley J., Lewis R., and BrandhamP. 2000. Nuclear DNA amounts in roses. Annals of Botany, 85: 557-561.

22- Zhou Z. 1999. The apple genetic resources in China: the wild species and their distributions, informative characteristics and utilisation. Genetic Researcha and Crop Evolution, 46: 599-609.